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不同基因型鹅星状病毒鉴别诊断RT-PCR方法的建立
引用本文:王宏宇,朱寅初,云涛,华炯钢,叶伟成,倪征,陈柳,张存.不同基因型鹅星状病毒鉴别诊断RT-PCR方法的建立[J].浙江农业科学,2021,62(11):2299-2302.
作者姓名:王宏宇  朱寅初  云涛  华炯钢  叶伟成  倪征  陈柳  张存
作者单位:1.浙江省农业科学院 畜牧兽医研究所,浙江 杭州 3100212.南京农业大学 动物医学院,江苏 南京 210095
基金项目:浙江省重点研发计划(2019C02052);浙江农业科学院2020年度青年人才培养项目(10102000320CC300G/003/020)
摘    要:鹅星状病毒(GAstV)是近年临床新发病原,也是导致当前雏鹅痛风致死的主要病因,研究显示该病毒存在两种不同基因型。为建立快速准确的核酸鉴别诊断方法,本研究针对不同基因型GAstV保守域RNA依赖性RNA聚合酶序列各设计1对特异性引物,建立以RNA为模板的双重一步法RT-PCR检测方法。条件优化试验结果显示,双重RT-PCR方法彼此无干扰;引物特异性强,对坦布苏病毒、鹅细小病毒、呼肠孤病毒、鸭瘟病毒的检测均为阴性;体系中引物适宜浓度为1 μmol,退火温度范围广,50~54 ℃皆可;敏感性高,最低检测限分别为103拷贝数和102拷贝数。对采集自江浙地区的73份样品进行检测,结果显示,鹅星状病毒阳性率为93.2%,主要为Ⅱ型星状病毒的单一感染(阳性率86.3%),部分样品呈现两种类型星状病毒混合感染现象(阳性率6.8%)。上述结果表明本研究建立的双重RT-PCR方法可用于GAstV的鉴别诊断和分子流行病学调查。

关 键 词:鹅星状病毒  一步法RT-PCR  基因型  检测方法  
收稿时间:2021-02-26
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