| 偏肿革裥菌系统发育与Lg-mnp2和Lg-mnp3基因克隆及结构特征 |
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| 引用本文： | 池玉杰,闫洪波,吴书景.偏肿革裥菌系统发育与Lg-mnp2和Lg-mnp3基因克隆及结构特征[J].东北林业大学学报,2019,47(2):64-69,87. |
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| 作者姓名： | 池玉杰 闫洪波 吴书景 |
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| 作者单位： | 东北林业大学,哈尔滨,150040;滨州市生物技术研究院;广西斯道拉恩索林业有限公司 |
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| 基金项目： | 中央高校基本科研业务费专项;外国文教专家聘请计划高校重点项目 |
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| 摘 要： | 白腐菌偏肿革裥菌Lenzites gibbosa能分泌降解木质素的锰过氧化物酶(MnPs),为进一步鉴定试验菌株,对菌株L. gibbosa CB1进行了ITS序列(Gen Bank登录号为JF279440)扩增与测序,并进行了基于ITS序列的比对与系统发育分析,结果表明CB1与桦革裥菌L. betulina和栓菌属Trametes等相关白腐菌的亲缘关系较近而聚类在一起,并与24个同种其他菌株的ITS序列覆盖度在85%～97%期间内的相似性都为99%,说明该菌株为偏肿革裥菌。为了获得该菌株多个编码MnP家族的基因,从而为研究MnP基因的表达调控奠定序列结构的基础,根据已知白腐菌MnPs基因保守区和已经扩增出的基因片段设计引物,以L. gibbosa CB1的基因组DNA和总RNA为模板,采用PCR、RT-PCR、RACE及染色体步移等方法,克隆到该菌株编码MnP2和MnP3的全长c DNA和DNA基因(Gen Bank登录号分别为JQ388597、JN571114; JQ411249、JN571116),分别命名为Lg-mnp2和Lg-mnp3。2个基因DNA全长分别为2 869、3 992 bp,都含有6个外显子和5个内含子;其启动子区域都含有TATA-Box、CAAT-Box、AP2、MRE等顺式作用元件,Lg-mnp2还含有AP1,Lg-mnp3还含有HSE;其c DNA基因分别含有50、52 bp的5'UTR,150、249 bp的3'UTR和1098、1 101 bp的完整开放阅读框ORF,分别编码了365、366个氨基酸的蛋白质多肽前体(Gen Bank登录号分别为AFC37493、AFC37494),成熟的Lg-mnp2蛋白含有339个氨基酸,比Lg-MnP1蛋白(Gen Bank登录号为ACO92620)多1个氨基酸;成熟的Lg-mnp3蛋白含有340个氨基酸,比Lg-MnP2蛋白多1个氨基酸。
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| 关 键 词： | 偏肿革裥菌 系统发育 锰过氧化物酶 基因克隆 序列分析 |
Phylogenetic Analysis and Cloning of the Gene Lg-mnp2 and Lg-mnp3 of Lenzites gibbosa CB1 |
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| Chi Yujie,Yan Hongbo,Wu Shujing.Phylogenetic Analysis and Cloning of the Gene Lg-mnp2 and Lg-mnp3 of Lenzites gibbosa CB1[J].Journal of Northeast Forestry University,2019,47(2):64-69,87. |
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| Authors: | Chi Yujie Yan Hongbo Wu Shujing |
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| Institution: | (Northeast Forestry University,Harbin 150040,P.R.China;Binzhou Institute of Biotechnology;Guangxi Stora Enso Forestry Co.,Ltd.) |
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| Abstract: | Chi Yujie;Yan Hongbo;Wu Shujing(Northeast Forestry University,Harbin 150040,P.R.China;Binzhou Institute of Biotechnology;Guangxi Stora Enso Forestry Co.,Ltd.) |
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| Keywords: | Lenzites gibbosa Phylogenetic analysis Manganese peroxidase(MnP) Gene cloning Sequence analysis |
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