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IBRV内蒙古分离株gD基因的分子克隆与序列分析
引用本文:胡文兵,关平原,李平安,乌日罕.IBRV内蒙古分离株gD基因的分子克隆与序列分析[J].内蒙古农业大学学报(自然科学版),2011,32(4):9-13.
作者姓名:胡文兵  关平原  李平安  乌日罕
作者单位:1. 内蒙古农业大学兽医学院,呼和浩特010018;塔里木大学动物科技学院,阿拉尔843300
2. 内蒙古农业大学兽医学院,呼和浩特010018;农业部动物疾病临床诊疗技术重点实验室,呼和浩特010018
3. 内蒙古动物疫病预防与控制中心,呼和浩特,010010
基金项目:内蒙古自然科学基金资助项目(200308020405)
摘    要:根据已发表的牛传染性鼻气管炎病毒( GenBank NC_001847) gD基因序列设计1对特异性引物,采用PCR方法扩增出内蒙古分离株gD基因的cDNA,重组到PMD19 -T载体中,并进行克隆及序列测定.经限制性内切酶谱分析和序列分析,证明所克隆的cDNA为gD基因.该基因片段长1 559bp,包含1个由1 251bp组成的完整开放阅读框(ORF),共编码417个氨基酸.序列比较和系统进化树分析结果显示:内蒙古分离株gD基因与GenBank上已发表的其它分离株相比,核苷酸同源性在99.1%~99.9%之间,其推导的氨基酸同源性在90..6%~99.8%之间,在系统进化树中内蒙分离株与AJ004801株亲缘关系较近,属于同1个分支.生物信息学分析表明,该基因编码的蛋白具有亲水性,有很强的抗原性,有3个潜在糖基化位点,可能存在2个蛋白激酶C磷酸化位点,存在4个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点.

关 键 词:牛传染性鼻气管炎病毒  gD基因  分子克隆  序列分析  生物信息学

CLONING AND SEQUENCE ANALYSIS OF THE gD GENE OF IBRV FROM INNER MONGOLIA
HU Wen-bing , GUAN Ping-yuan , LI Ping-An , WU ri-han.CLONING AND SEQUENCE ANALYSIS OF THE gD GENE OF IBRV FROM INNER MONGOLIA[J].Journal of Inner Mongolia Agricultural University(Natural Science Edition),2011,32(4):9-13.
Authors:HU Wen-bing  GUAN Ping-yuan  LI Ping-An  WU ri-han
Institution:1.College of Veterinary Medicine,Inner Mongolia Agricultural University,Huhhot 010018,China;2.Key Laboratory of Clinical Diagnosis and Treatment Techniques for Animal Disease of Ministry of Agriculture,Huhhot 010018,China; 3. College of Animal Science and Technology,Tarim University,Xinjiang,Alar 843300,China;4. Center of Prevent and Control of Animal Disease of Inner Mongolia,Huhhot 010010,China)
Abstract:
Keywords:
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