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Ⅰ型鸭肝炎病毒F株基因组测序及其结构分析
引用本文:吴培福,韩博,张国中,刘金华,苏敬良.Ⅰ型鸭肝炎病毒F株基因组测序及其结构分析[J].中国农业大学学报,2008,13(6).
作者姓名:吴培福  韩博  张国中  刘金华  苏敬良
作者单位:中国农业大学,动物医学院,北京,100193
摘    要:通过鸭肝炎病毒F株的测序分析研究了鸭肝炎病毒基因组间的变异情况,为鸭肝炎病毒病的防治提供线索.结果表明DHV-F具有DHV-Ⅰ所具有的基本特征此外还有如下特点:1)DHV-F 5′UTR含有8个茎环结构,且有2个GNRA基序、A/C富含区、U/C富含区、A富含环和U富含环;2)2C蛋白基序DDLxQ中的亮氨酸被苯丙氨酸(192~196 aa)所替代;3)3D蛋白基序PSG中的脯氨酸被半胱氨酸(280~282 aa)所替代;4)预测表明3D蛋白具有"指、拇指和掌"的空间构象,且具有一个大的开放性的中间槽;5)3D蛋白所有保守基序位于蛋白亚基的内层;6)DHV-F的多聚蛋白P2和P3与DHV-Ⅰ的相应蛋白片段有较高的同源性,而与P1的同源性相对较低.说明鸭肝炎病毒DHV-F有抗原性变异.

关 键 词:  基因组  测序  进化  变异

Sequencing and molecular analysis of duck hepatitis virus type 1, strain F
WU Pei-fu,HAN Bo,ZHANG Guo-zhong,LIU Jin-hu,SU Jing-liang.Sequencing and molecular analysis of duck hepatitis virus type 1, strain F[J].Journal of China Agricultural University,2008,13(6).
Authors:WU Pei-fu  HAN Bo  ZHANG Guo-zhong  LIU Jin-hu  SU Jing-liang
Abstract:
Keywords:DHV-F
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