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| 基于CRISPR数据库的病原菌CRISPR结构分析 | |
| 摘 要： | 成簇的规律间隔短回文重复序列(CRISPR)是大多数细菌和古菌在生存压力下进化出的一套抵抗噬菌体干扰的防御系统。采用生物信息学方法,首先根据VFDB、PHI-base和NMPDR病原菌数据库确定了CRISPR数据库中2 612株细菌中的549株植物、动物及人体病原菌菌株,然后对病原菌菌株和总菌株的CRISPR结构进行比较分析。结果表明:病原菌菌株中含有CRISPR结构的菌株比例为48.5%,略高于总菌株中的比例;但间隔序列的数量在总菌株和病原菌菌株中的差异显著,病原菌菌株间隔序列分布情况均低于细菌的平均水平;病原菌菌株CRISPR结构中病毒来源的间隔序列比质粒来源所占比例大。通过对病原菌CRISPR结构的分析,为进一步理解病原菌的生活和动植物宿主菌的获得性免疫防御系统提供了理论指导。 |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ | |