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利用SRAP分子标记研究河川沙塘鳢群体的遗传多样性
引用本文:侯新远,张洪伟,尹绍武,张丽娟,胡亚丽.利用SRAP分子标记研究河川沙塘鳢群体的遗传多样性[J].江苏农业科学,2014(10).
作者姓名:侯新远  张洪伟  尹绍武  张丽娟  胡亚丽
作者单位:南京师范大学生命科学学院/江苏省生物多样性与生物技术重点实验室,江苏南京,210023
基金项目:国家星火计划,江苏省科技支撑计划(农业)项目,“江苏省六大人才高峰”高层次人才项目,江苏省农业科技自主创新资金,南京师范大学科技成果转化基金,江苏省扬州市农业科技攻关计划,。
摘    要:利用相关序列扩增多态性SRAP分子标记对3个河川沙塘鳢(Odontobutis potamophila)自然群体安徽省当涂(DT)群体、浙江省余姚(YY)群体、江苏省太湖东西山(DXS)群体]进行了遗传多样性分析。从196对引物组合中筛选出11对扩增条带清晰、稳定的引物组合对3个群体进行扩增,共获得71个位点;3个群体内多态位点占比为6.90%~24.14%,其中DT群体多态位点占比为6.90%,YY群体多态位点占比为24.14%、DXS群体多态位点占比为24.14%;群体的Nei's基因多样性指数(H)为0.033 0~0.093 9DT(0.033 0)YY(0.078 4)DXS(0.093 9)],群体Shannon's多样性指数(I)为0.046 3~0.136 8DT(0.046 3YY(0.120 6)DXS(0.136 8)]。可见DXS群体、YY群体的多态位点占比、Nei's基因多样性、Shannon's多样性指数均稍高于DT群体。研究还发现,3个群体间的Nei's无偏遗传距离为0.036 3~0.286 7,遗传相似度为0.750 7~0.964 4,DXS群体与YY群体的遗传距离最小(0.036 3),遗传相似度最大(0.964 4),亲缘关系最近。采用UPGMA法对3个群体进行聚类分析显示,YY群体和DXS群体聚为1支,DT群体聚为单独的1支。综合试验结果表明,3个河川沙塘鳢自然群体的遗传多样性较低。

关 键 词:河川沙塘鳢  相关序列扩增多态性  遗传多样性  多样性指数
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