欧李Dof基因家族鉴定及非生物胁迫表达分析 |
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引用本文: | 赵雅欣,郭夕雯,郭子微,张建英,芦容,王鹏飞,穆霄鹏,张帅,杜俊杰,张建成.欧李Dof基因家族鉴定及非生物胁迫表达分析[J].经济林研究,2023(1):143-153. |
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作者姓名: | 赵雅欣 郭夕雯 郭子微 张建英 芦容 王鹏飞 穆霄鹏 张帅 杜俊杰 张建成 |
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作者单位: | 山西农业大学园艺学院 |
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基金项目: | 山西省重点研发计划项目(201703D221028-4);;山西省应用基础研究项目(201801D121251);;山西省现代农业产业技术体系建设专项(SXFRS-2022); |
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摘 要: | 【目的】探究欧李Dof(DNA-binding with one zinc finger)锌指蛋白在非生物胁迫条件下的功能,为ChDof基因的研究与利用奠定基础。【方法】基于欧李全基因组和转录组数据对Dof基因家族进行鉴定,并利用实时定量PCR分析Dof基因在非生物胁迫下的表达情况。【结果】欧李共有23个Dof基因家族成员,其编码区CDS序列长度为226~515 bp,相对分子质量为24 227.52~55 368.21,理论等电点为4.78~9.36,且其在欧李的8条染色体上都有分布。在构建欧李和拟南芥的系统进化树中发现,欧李共分为9个亚组,同一亚族成员中的基因结构和蛋白保守基序均具有较高的相似性,且欧李Dof基因家族成员主要分布在D1亚组中。在对其亚细胞定位时发现,绝大多数ChDof基因主要分布于细胞核中。对欧李Dof家族成员启动子区域顺式调控元件的预测结果表明,其启动子区存在着至少1个激素调节及逆境胁迫反应元件。qRT-PCR分析结果表明,绝大多数的ChDof基因在盐、高温和低温胁迫下的表达量均上调,而ChDof11、ChDof12、ChDof17基因在盐、渗透(PEG)、高温和...
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关 键 词: | 欧李 Dof 基因家族分析 非生物胁迫 基因表达 |
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