| 北美鹅掌楸LtCHS基因的克隆及生物信息学与组织表达特征分析 |
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| 引用本文： | 罗群凤,胥猛,冯源恒,徐嘉娟,李火根.北美鹅掌楸LtCHS基因的克隆及生物信息学与组织表达特征分析[J].林业科学,2015(5). |
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| 作者姓名： | 罗群凤 胥猛 冯源恒 徐嘉娟 李火根 |
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| 作者单位： | 1. 南京林业大学 林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室 南京 210037; 广西壮族自治区林业科学研究院 南宁 530002
2. 南京林业大学 林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室 南京 210037 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(30972391 |
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| 摘 要： | 【目的】鹅掌楸属花色种间差异较大，是研究木本植物花色形成与调控机制的较理想材料。查尔酮合成酶基因( CHS)是黄酮类化合物生物合成途径中的关键基因，与植物花色形成密切相关，同时又是研究科以下系统发育的理想基因，种间进化差异较大，因此 CHS基因用于研究鹅掌楸属花色差异形成机制有较强的可行性。本研究克隆北美鹅掌楸的查尔酮合成酶基因，并对其进行生物信息学及组织表达分析，以期为鹅掌楸属树种花色的形成和调控机制研究提供参考。【方法】以北美鹅掌楸的花芽为材料，采用同源克隆和 RACE 技术克隆查尔酮合成酶基因( LtCHS)，并进一步扩增该基因的基因组序列。对该基因进行生物信息学分析。采用半定量 RT-PCR 方法分析 LtCHS基因在鹅掌楸属种间及不同组织中的表达水平。【结果】获得2个查尔酮合成酶基因： LtCHS1与LtCHS2。LtCHS1基因的 cDNA全长875 bp，包含1个702 bp的ORF，其基因组DNA ( gDNA)只含有1个外显子，没有内含子，编码233个氨基酸，蛋白质分子量为71.88 kDa，等电点为5.09。LtCHS2基因的 cDNA 全长1457 bp，包括1个1185 bp的 ORF，其 gDNA含有2个外显子和1个内含子，编码394个氨基酸，蛋白质分子量为120.0 kDa，等电点为4.97。2个基因的组织表达分析结果显示，LtCHS 基因不仅在同一树种不同组织间存在差异，而且在种间也存在表达差异。LtCHS1基因仅在北美鹅掌楸中表达，LtCHS2基因在鹅掌楸中表达，在杂交鹅掌楸中二者均有表达。【结论】获得的2个 LtCHS基因属于同一基因家族，但执行不同功能。二者在种间表达存在差异可能与鹅掌楸属花色形成有关。结合鹅掌楸属种间花色特征，可初步推测，LtCHS1基因与 LtCHS2基因可能分别调控不同类型花青素的合成。
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| 关 键 词： | 北美鹅掌楸 查尔酮合成酶 基因克隆 半定量RT-PCR 组织表达 |
Cloning and Bioinformatics of Chalcone Synthase Gene (CHS) in Liriodendron tulipifera and Characterization of Its Tissue Expression |
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| Luo Qunfeng,Xu Meng,Feng Yuanheng,Xu Jiajuan,Li Huogen.Cloning and Bioinformatics of Chalcone Synthase Gene (CHS) in Liriodendron tulipifera and Characterization of Its Tissue Expression[J].Scientia Silvae Sinicae,2015(5). |
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| Authors: | Luo Qunfeng Xu Meng Feng Yuanheng Xu Jiajuan Li Huogen |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Liriodendron tulipifera chalcone synthase gene cloning semi-quantitative RT-PCR tissue expression |
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