| 植物CBF1转录因子的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 蒋瑶,陈其兵.植物CBF1转录因子的生物信息学分析[J].林业科学,2010,46(6). |
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| 作者姓名： | 蒋瑶 陈其兵 |
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| 作者单位： | 四川农业大学林学院,雅安,625014 |
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| 基金项目： | 国家科技支撑计划项目，四川省"十一五"重点攻关项目 |
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| 摘 要： | 利用生物信息学手段,对GenBank中18种不同植物CBF1的氨基酸序列进行比对及系统发育树的构建,并对其氨基酸的组成、等电点、亲水/疏水性、蛋白质的二级结构和三级结构及功能域进行分析预测.结果表明:18种不同植物CBF1的N端存在富含精氨酸和赖氨酸残基的核定位信号(NLS)、与DNA结合的AP2核心结构域以及C端的酸性氨基酸.构建CBF1进化树,并对其分子进化进行探讨.CBF1的氨基酸主要是脂肪族类,都含有非极性氨基酸Ala,其蛋白等电点多数为酸性,且为不稳定亲水性蛋白.a-螺旋和无规则卷曲是18种不同植物CBF1最大量的结构元件,而B-转角和延伸链则散布于整个蛋白质中.不同植物CBF1蛋白的亚细胞定位存在一定的差异.三维结构检测表明此模型的结构符合立体化学规则.
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| 关 键 词： | 生物信息学 分子进化 |
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