9种狼尾草属植物叶绿体基因组特征分析 |
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引用本文: | 胥富强,王海洋,师春娟,辛培尧,段利武,王齐.9种狼尾草属植物叶绿体基因组特征分析[J].西部林业科学,2024(1):88-98. |
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作者姓名: | 胥富强 王海洋 师春娟 辛培尧 段利武 王齐 |
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作者单位: | 1. 甘肃省小陇山林业调查规划院;2. 西南林业大学林学院;3. 云南林业职业技术学院 |
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基金项目: | 云南省教育厅科学研究基金项目“观赏狼尾草属植物种质优选及其系统发育研究(编号:2022J1382)”; |
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摘 要: | 狼尾草属为禾本科1 a生或多年生草本植物,该属植物在饲用、保护生态、观赏等方面均有良好的应用价值。为探讨狼尾草属植物叶绿体基因组的遗传结构及进化特征,基于基因组浅层测序技术获得狼尾草属9种植物叶绿体基因组序列,对其组装与注释后进行生物信息学分析。结果显示:(1)9种狼尾草属植物叶绿体基因组均为典型的四分体结构,其大小在137 929~138 554 bp之间。叶绿体基因组GC含量范围为38.6%~38.7%,其中IR区GC含量最高,为44%~44.1%,各叶绿体基因组结构无明显差异,在IR/SC交界区表现出微小差异。(2)共注释113个基因,包括78个编码蛋白基因、31个tRNA基因和4个rRNA基因。对序列进行简单重复序列检测,共检测到389个SSRs位点,其中单核苷酸重复数量最多,而在非简单序列重复检测中,串联重复所占比例最高。(3)变异位点主要存在于叶绿体LSC和SSC区,筛选出9个差异较大的区域,可作为狼尾草属植物的潜在遗传标记。(4)基于31条狼尾草属植物样本叶绿体基因组序列构建了狼尾草属系统发育树,结果形成两大分支,阐明了狼尾草属植物种间亲缘关系。本研究可为狼尾草属植物的分...
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关 键 词: | 狼尾草属 叶绿体基因组 序列分析 系统发育 |
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