| 香蕉GAPDH基因家族的生物信息学及转录表达分析 |
| |
| 引用本文： | 史后蕊,冯仁军,王静毅,柴娟,任梦云,卢利方,张银东.香蕉GAPDH基因家族的生物信息学及转录表达分析[J].热带作物学报,2014,35(6):117-1123. |
| |
| 作者姓名： | 史后蕊 冯仁军 王静毅 柴娟 任梦云 卢利方 张银东 |
| |
| 作者单位： | 1 海南大学农学院 2 中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室;中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室;中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室;1 海南大学农学院 2 中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室;1 海南大学农学院 2 中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室;中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室;海南大学农学院 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（No. 31201603）；国家863计划项目子课题（No. 2012AA101204-2）；海南省自然科学基金项目（No. 312050，No. 312051）；海南省研究生创新课题（No. Hys2012-18)；海南省重大科技项目子课题（No. ZDZX2013023-1）；中央级公益性科研院所基本科研业务费项目（No. ITBB130201）。 |
| |
| 摘 要： | 从香蕉基因组数据库和NCBI数据库中检索香蕉GAPDH基因家族的所有成员,并采用生物信息学方法对其进行亚细胞定位、进化树分析和保守结构域预测。克隆测序发现,巴西蕉内的GAPDH基因家族成员序列与小果野蕉基因组数据库中提供的序列基本一致,同源性超过98%。转录表达分析表明,GAPDH基因家族成员在巴西蕉不同器官的表达模式多样:MaGAPCP1,MaGAPC6/8/10/11成组成型表达,其余的基因则在各组织器官间成差异型表达,且差异型表达的基因在不同组织器官中表达模式也不相同,组成型表达的基因在不同组织器官中表达模式虽相同,但表达量有差异。GAPDH基因家族成员在表达模式上的多样化,可能暗示其功能的多样化,这种多样化可能是在进化过程中为适应环境而出现的功能分化或冗余。结果为进一步研究GAPDH基因家族成员在香蕉生长、发育,非生物胁迫,果实后熟等重要生物学过程中的功能奠定基础。
|
| 关 键 词： | 香蕉 GAPDH基因家族 生物信息学分析 表达分析 |
Bioinformatics and Expression Analysis of Banana GAPDH Gene Family |
| |
| SHI Hourui,FENG Renjun,WANG Jingyi,CHAI Juan,REN Mengyun,LU Lifang and ZHANG Yindong.Bioinformatics and Expression Analysis of Banana GAPDH Gene Family[J].Chinese Journal of Tropical Crops,2014,35(6):117-1123. |
| |
| Authors: | SHI Hourui FENG Renjun WANG Jingyi CHAI Juan REN Mengyun LU Lifang and ZHANG Yindong |
| |
| Institution: | 1 College of Agronomy, Hainan University 2 Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences,;Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences;Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences;1 College of Agronomy, Hainan University 2 Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences,;1 College of Agronomy, Hainan University 2 Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences,;Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences;College of Agronomy, Hainan University |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | Banana GAPDH gene family Bioinformatics analysis Expression analysis |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《热带作物学报》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《热带作物学报》下载免费的PDF全文 |
|
