| 缢蛏IGFBP基因结构及生长性状相关SNP筛选 |
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| 引用本文： | 谢淑媚,牛东红,阮海灯,王泽,王飞,陈世娥,李家乐.缢蛏IGFBP基因结构及生长性状相关SNP筛选[J].水产学报,2015,39(6):799-809. |
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| 作者姓名： | 谢淑媚 牛东红 阮海灯 王泽 王飞 陈世娥 李家乐 |
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| 作者单位： | 上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室, 上海 201306,上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室, 上海 201306,上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室, 上海 201306,上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室, 上海 201306,上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室, 上海 201306,上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室, 上海 201306,上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室, 上海 201306 |
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| 基金项目： | 国家“八六三”高技术研究发展计划(2012AA10A400);国家自然科学基金(31472278);上海知识服务平台(ZF1206) |
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| 摘 要： | 类胰岛素生长因子结合蛋白(IGFBP)是IGF系统的一部分,主要参与IGF的运输、定位和生物活性调节。本研究采用RACE技术和长PCR技术,克隆了缢蛏IGFBP基因的cDNA和DNA全长序列,应用荧光定量PCR技术分析了缢蛏不同发育时期和不同组织中IGFBP mRNA的表达特征,并进一步筛选了IGFBP基因与生长性状相关的SNP位点。序列分析表明,缢蛏IGFBP cDNA序列全长631 bp,包括5'端非编码区60 bp,3'端非编码区136 bp和开放阅读框435 bp,编码144个氨基酸。该基因含有保守的IGFBP-N端,包含12个半胱氨酸残基,其中1～18个氨基酸为信号肽,属于分泌型蛋白。IGFBP DNA全长3 122 bp,其中包含1个内含子(2 687 bp)和2个外显子(200和235 bp)。荧光定量PCR结果显示,IGFBP mRNA在消化腺组织中表达量最高;在缢蛏的稚贝期,IGFBP mRNA呈现高表达,而在其他发育时期表达量低。在IGFBP基因中筛选到4个SNP位点,其中1个SNP位点与缢蛏的壳长和体质量呈显著相关。
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| 关 键 词： | 缢蛏 类胰岛素生长因子结合蛋白(IGFBP) 基因表达 单核苷酸多态性(SNP) 关联分析 |
| 收稿时间： | 2014/12/24 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2015/3/13 0:00:00 |
Molecular characterization of IGFBP and association analysis with growth traits in the razor clam Sinonovacula constricta |
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| XIE Shumei,NIU Donghong,RUAN Haideng,WANG Ze,WANG Fei,CHEN Shi''e and LI Jiale.Molecular characterization of IGFBP and association analysis with growth traits in the razor clam Sinonovacula constricta[J].Journal of Fisheries of China,2015,39(6):799-809. |
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| Authors: | XIE Shumei NIU Donghong RUAN Haideng WANG Ze WANG Fei CHEN Shi'e and LI Jiale |
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| Institution: | Key Laboratory of Freshwater Aquatic Genetic Resource, Ministry of Aqriculture, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China,Key Laboratory of Freshwater Aquatic Genetic Resource, Ministry of Aqriculture, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China,Key Laboratory of Freshwater Aquatic Genetic Resource, Ministry of Aqriculture, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China,Key Laboratory of Freshwater Aquatic Genetic Resource, Ministry of Aqriculture, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China,Key Laboratory of Freshwater Aquatic Genetic Resource, Ministry of Aqriculture, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China,Key Laboratory of Freshwater Aquatic Genetic Resource, Ministry of Aqriculture, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China and Key Laboratory of Freshwater Aquatic Genetic Resource, Ministry of Aqriculture, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Sinonovacula constricta insulin-like growth factor binding protein gene expression SNP association analysis |
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