| 团头鲂Hox基因家族的鉴定、进化与表达分析 |
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| 引用本文： | 刘宁,黄欣,刘寒,王卫民.团头鲂Hox基因家族的鉴定、进化与表达分析[J].水产学报,2021,45(2):161-169. |
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| 作者姓名： | 刘宁 黄欣 刘寒 王卫民 |
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| 作者单位： | 华中农业大学水产学院，农业部淡水生物繁殖重点实验室,华中农业大学水产学院，农业部淡水生物繁殖重点实验室,华中农业大学水产学院，农业部淡水生物繁殖重点实验室,华中农业大学水产学院，农业部淡水生物繁殖重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家自然基金青年项目（31702315） |
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| 摘 要： | Hox基因家族在调控动物早期胚胎发育、组织和器官生长起重要作用，因此这类基因家族被广泛应用到物种进化和发育调控的研究中。为了探究Hox基因在团头鲂中分布，进化及表达调控作用，同时为了探究Hox基因与团头鲂肌间刺发育的关系，研究基于团头鲂全基因组数据，结合生物信息学分析方法对其Hox基因家族进行鉴定、染色体分布、系统进化和表达模式分析。结果显示，在团头鲂基因组中共鉴定出49个Hox基因，根据系统进化分析分为5个亚类；其中49个Hox基因不均匀的分布在5条染色体上，并分为7个基因连锁群（HoxAa、HoxAb、HoxBa、HoxBb、HoxCa、HoxCb和HoxDa）；表达模式分析结果表明，团头鲂Hox基因家族成员具有不同的表达模式；团头鲂和斑马鱼所有Hox基因在肌肉中的表达水平存在显著差异。此外，团头鲂不同发育阶段及不同组织转录组结果显示，HoxA基因群集中，HoxA2a、HoxA3a在幼鱼阶段高表达，其他基因在肌肉、肌间刺及结缔组织中表达量低甚至不表达；HoxB基因群集中，HoxB9a、HoxB3a、HoxB8a、HoxB1b、HoxB5a、HoxB5b在幼鱼阶段高表达；HoxB7a、HoxB10a、HoxB9a在成鱼肌肉、结缔组织及肌间刺中高表达；HoxC基因群集中，HoxC3a、HoxC4a在幼鱼阶段高表达，HoxC3a、HoxC8a在成鱼的3个组织都有表达；HoxD基因群集中，HoxD9a、HoxD10a和HoxD11a在胚胎S2期表达量较高。研究表明，Hox基因在团头鲂早期胚胎时期和肌间刺的形成中有表达，提示团头鲂肌间刺的形成可能受Hox基因家族调控。
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| 关 键 词： | 团头鲂 Hox基因家族 基因鉴定 表达分析 |
| 收稿时间： | 2020/6/4 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2020/7/15 0:00:00 |
Identification, evolution and expression pattern of Hox gene family in Megalobrama amblycephala |
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| LIU Ning,HUANG Xin,LIU Han,WANG Weimin.Identification, evolution and expression pattern of Hox gene family in Megalobrama amblycephala[J].Journal of Fisheries of China,2021,45(2):161-169. |
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| Authors: | LIU Ning HUANG Xin LIU Han WANG Weimin |
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| Institution: | College of Fisheries, Huazhong Agricultural University, Key Laboratory of Freshwater Biological Reproduction, Ministry of Agriculture,,College of Fisheries, Huazhong Agricultural University, Key Laboratory of Freshwater Biological Reproduction, Ministry of Agriculture, |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Megalobrama amblycephala Hox gene family Genetic identification Expression analysis |
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