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仿刺参铁蛋白ferritin基因的序列分析及表达
引用本文:杨爱馥,周遵春,孙大鹏,董颖,姜北,汪笑宇,陈仲,关晓燕,王摆.仿刺参铁蛋白ferritin基因的序列分析及表达[J].水产学报,2010,34(6):710-717.
作者姓名:杨爱馥  周遵春  孙大鹏  董颖  姜北  汪笑宇  陈仲  关晓燕  王摆
作者单位:辽宁省海洋水产科学研究院,辽宁省海洋水产分子生物学重点实验室,辽宁,大连,116023
基金项目:国家自然科学基金项目(30972272);国家 “八六三”高技术研究发展计划(2006AA10A411);国家海洋公益性行业科研专项(200705007);辽宁省科技计划(2008203002)
摘    要:通过构建仿刺参cDNA文库,获得铁蛋白全长cDNA序列。该基因序列全长792 bp,5′非翻译区长133 bp,开放阅读框长522 bp,编码173个氨基酸,3′UTR长137 bp;预测蛋白分子量为20 ku。5′UTR具有一个高度保守的铁离子应答元件。仿刺参ferritin氨基酸序列具备脊椎动物ferritin的亚铁氧化酶活性中心所特有的保守结构。该序列与海参的同源性最高,达84%,与其它无脊椎动物如:海星、鲍、牡蛎、海葵、线虫、小龙虾和果蝇的同源性为74%~34%;与脊椎动物ferritin重链亚基同源性高于轻链亚基。系统进化分析表明,仿刺参的ferritin与大部分无脊椎动物聚为一支。利用半定量RT-PCR检测,ferritin mRNA在仿刺参未受精卵、受精卵、多细胞期、囊胚期、原肠期、小耳状幼体、中耳状幼体、大耳状幼体、樽型幼体、五触手幼体、稚参11个发育阶段和幼参的体壁、体腔细胞、肠道和呼吸树中均表达。Quantitative real-time PCR结果显示, ferritin mRNA在未受精卵至原肠期表达量低,从小耳状幼体至稚参表达量显著增高;在幼参的不同组织中,ferritin mRNA在呼吸树中的表达量显著低于其他3种组织;幼参注射LPS后,4种组织中ferritin mRNA表达量与注射前无显著差异。

关 键 词:仿刺参    铁蛋白ferritin基因    序列分析    基因表达    LPS刺激
收稿时间:1/4/2010 12:00:00 AM
修稿时间:2010/3/18 0:00:00

Sequence analysis and expression pattern of ferritin gene in sea cucumber(Apostichopus japonicus)
YANG Ai-fu,ZHOU Zun-chun,SUN Da-peng,DONG Ying,JIANG Bei,WANG Xiao-yu,CHEN Zhong,GUAN Xiao-yan and WANG Bai.Sequence analysis and expression pattern of ferritin gene in sea cucumber(Apostichopus japonicus)[J].Journal of Fisheries of China,2010,34(6):710-717.
Authors:YANG Ai-fu  ZHOU Zun-chun  SUN Da-peng  DONG Ying  JIANG Bei  WANG Xiao-yu  CHEN Zhong  GUAN Xiao-yan and WANG Bai
Abstract:
Keywords:sea cucumber(Apostichopus japonicus)  ferritin  sequence analysis  gene expression  LPS challenge
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