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低氧胁迫下鲢miR-17a-5p及其靶基因分析
引用本文:李晓晖,冯翠,王巧欣,邹桂伟,梁宏伟.低氧胁迫下鲢miR-17a-5p及其靶基因分析[J].水产学报,2023,47(1):019610-019610.
作者姓名:李晓晖  冯翠  王巧欣  邹桂伟  梁宏伟
作者单位:中国水产科学研究院长江水产研究所,湖北 武汉 430223;中国水产科学研究院长江水产研究所,湖北 武汉 430223;华中农业大学湖北洪山实验室,湖北 武汉 430070
基金项目:国家现代农业产业技术体系专项(CARS-45);湖北省洪山实验室开放课题(2021hskf014);中国水产科学研究院基本科研业务费专项(YFI202211,2020TD33)
摘    要:为了探究miR-17a-5p在鲢低氧胁迫下的功能,在前期鲢small RNA测序的基础上对鲢miR-17a-5p进行靶基因预测及功能富集分析,通过双荧光素酶活性验证其与HIF-1α的靶向关系,并检测低氧胁迫下miR-17a-5p和其靶基因在鲢肝脏、脑、心脏和鳃四个组织中的动态表达特征。结果显示,鲢miR-17a-5p在不同物种间高度保守,预测出381个miR-17a-5p的潜在靶基因显著富集在硫代谢、mTOR信号通路以及萜类骨架的生物合成3个KEGG信号通路上。miR-17a-5p可与HIF-1α mRNA的3′UTR结合,并降低HIF-1α mRNA水平,低氧胁迫下miR-17a-5p的表达呈下降趋势,而HIF-1α表达则呈上升趋势;3个显著富集KEGG通路中的11个miR-17a-5p潜在靶基因在低氧胁迫过程中的不同组织中的表达,尤其是肝脏中的表达,除SGK1外,均呈显著上升趋势。研究表明,低氧胁迫下鲢各组织中miR-17a-5p的表达下调减弱了其对靶基因的抑制作用,进而导致HIF-1α、ddit4和Lrp5等响应低氧胁迫的基因表达上调。本研究为低氧胁迫下鲢miRNA的表达与调控机...

关 键 词:  miR-17a-5p  低氧  双荧光素酶  靶基因  信号通路
收稿时间:2022/10/30 0:00:00
修稿时间:2022/12/3 0:00:00

Analysis of miR-17a-5p and its target genes in Hypophthalmichthys molitrix under hypoxia stress
LI Xiaohui,FENG Cui,Wang Qiaoxin,ZOU Guiwei,LIANG Hongwei.Analysis of miR-17a-5p and its target genes in Hypophthalmichthys molitrix under hypoxia stress[J].Journal of Fisheries of China,2023,47(1):019610-019610.
Authors:LI Xiaohui  FENG Cui  Wang Qiaoxin  ZOU Guiwei  LIANG Hongwei
Institution:Yangtze River Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Wuhan 430223, China; Yangtze River Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Wuhan 430223, China;Hubei Hongshan Laboratory, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, China
Abstract:
Keywords:Hypophthalmichthys molitrix  miR-17a-5p  hypoxia  dual-luciferase reporter assay  target genes  pathway
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