| 东山湾青石斑鱼线粒体DNA D-loop区遗传多样性分析 |
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| 引用本文： | 吕子君,陈金涛,王超,谢少林,邹记兴.东山湾青石斑鱼线粒体DNA D-loop区遗传多样性分析[J].水产学报,2014,38(9):1270-1276. |
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| 作者姓名： | 吕子君 陈金涛 王超 谢少林 邹记兴 |
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| 作者单位： | 华南农业大学动物科学学院, 广东 广州 510642;华南农业大学动物科学学院, 广东 广州 510642;清远市北江水产科学研究所, 广东 清远 511510;华南农业大学动物科学学院, 广东 广州 510642;华南农业大学动物科学学院, 广东 广州 510642;华南农业大学动物科学学院, 广东 广州 510642 |
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| 基金项目： | 国家科技支撑计划（2013BAD10B04-1） |
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| 摘 要： | 为研究青石斑鱼种群遗传结构以实现资源保护和可持续利用,实验采用PCR技术对东山湾水域53尾青石斑鱼种群的线粒体DNA(mtDNA)D-loop区全序列进行扩增并测序,序列长度为956~1 230 bp,变异很大,这可能是由于5'端含有数目不等的重复序列单元(repeat sequence unit,RSU)或者由于碱基的插入和缺失造成的。按照RSU数目的不同,把53个青石斑鱼样本分为3大类:2RSU类(占11.3%)、3RSU类(占77.4%)、4RSU类(占11.3%)。采用MEGA(version 3.0)和DnaSP(version 4.0)软件对序列进行分析,结果显示,53条序列的T、C、A和G碱基平均含量分别为33.4%、17.3%、35.4%和13.9%,共发现53种单倍型,包括179个多态位点,单倍型间平均遗传距离为0.019 7,单倍型多态性(Hd)为1.000,核苷酸多态性(π)值为0.017 2。研究表明,东山湾青石斑鱼种群的遗传多样性处于中等水平。
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| 关 键 词： | 青石斑鱼 线粒体DNA D-loop 遗传多样性 东山湾 |
| 收稿时间： | 5/3/2014 12:00:00 AM |
| 修稿时间： | 7/7/2014 12:00:00 AM |
Analysis of mitochondrial DNA D-loop genetic diversity of Epinephelus awoara in Dongshan Bay |
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| LV Zijun,CHEN Jintao,WANG Chao,XIE Shaolin and ZOU Jixing.Analysis of mitochondrial DNA D-loop genetic diversity of Epinephelus awoara in Dongshan Bay[J].Journal of Fisheries of China,2014,38(9):1270-1276. |
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| Authors: | LV Zijun CHEN Jintao WANG Chao XIE Shaolin and ZOU Jixing |
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| Institution: | College of Animal Science, South China Agricultural University, Guangzhou 510642, China;College of Animal Science, South China Agricultural University, Guangzhou 510642, China;Qingyuan North River Fishery Science Institute, Qingyuan 511510, China;College of Animal Science, South China Agricultural University, Guangzhou 510642, China;College of Animal Science, South China Agricultural University, Guangzhou 510642, China;College of Animal Science, South China Agricultural University, Guangzhou 510642, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Epinephelus awoara mitochondrial DNA D-loop genetic diversity Dongshan Bay |
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