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实验红鲫线粒体DNA条形码特征分析及应用
引用本文:王余德,李登科,陈科洁,吴端生,刘少军.实验红鲫线粒体DNA条形码特征分析及应用[J].水产学报,2021,45(1):1-9.
作者姓名:王余德  李登科  陈科洁  吴端生  刘少军
作者单位:湖南师范大学,南华大学,南华大学,南华大学,湖南师范大学
基金项目:“十二五”国家科技支撑计划项目(No. 2015BAIO9BO5);湖南省科学技术厅科技计划重点项目(No. 2014TT1002)
摘    要:为探索建立具有实验红鲫品系特异性的线粒体DNA条形码,对鲫属品种进行鉴定。本研究以实验红鲫和鲫属其他鱼类(洞庭湖鲫、日本白鲫、大眼鲫、兰氏鲫、金鱼、湘军金鱼和湘军花鲫)为测试群体,利用Sanger测序对所有个体的线粒体COⅠ、COⅢ、Cytb这3个基因和D-loop进行测序,同时构建3个基因的拼接序列,并分析它们的序列特征和10种鲫属鱼类分子系统进化的聚类特征。结果显示,COⅠ、COⅢ、Cytb这3个基因的拼接序列和COⅠ基因的进化树聚类能明显地发现10种不同的鲫属鱼类聚成不同的小支,而COⅢ基因和D-loop序列聚类不能同时区分10种鲫属鱼类。研究表明,通过COⅠ基因以及3个基因的拼接序列均能有效地鉴别实验红鲫与鲫属其他鱼类,故该类序列能作为实验红鲫的有效分子标记,同时COⅠ、COⅢ、Cytb和D-loop序列构建的进化树均可以反映10种不同鲫属鱼类之间的进化关系。

关 键 词:实验红鲫,条形码,进化树
收稿时间:2019/11/4 0:00:00
修稿时间:2020/6/13 0:00:00

Characteristics analysis and application of mitochondrial DNA barcoding in laboratory red crucian carp (Carassius carassius, red variety)
WANG Yude,LI Dengke,CHEN Kejie,WU Duansheng,LIU Shaojun.Characteristics analysis and application of mitochondrial DNA barcoding in laboratory red crucian carp (Carassius carassius, red variety)[J].Journal of Fisheries of China,2021,45(1):1-9.
Authors:WANG Yude  LI Dengke  CHEN Kejie  WU Duansheng  LIU Shaojun
Institution:Hunan Normal University,Nanhua University,Nanhua University,Nanhua University,Hunan Normal University
Abstract:
Keywords:labotatory red crucian carp  bar code  phylogenetic tree
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