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大口黑鲈POU1F1启动子区域SNPs对生长的影响
引用本文:杜芳芳,白俊杰,李胜杰,李小慧,樊佳佳.大口黑鲈POU1F1启动子区域SNPs对生长的影响[J].水产学报,2011,35(6):793-800.
作者姓名:杜芳芳  白俊杰  李胜杰  李小慧  樊佳佳
作者单位:中国水产科学研究院珠江水产研究所,中国水产科学研究院热带亚热带鱼类选育与养殖重点开放实验室,广东,广州,510380
基金项目:国家自然科学基金项目(30901102);国家“十一五”科技支撑计划(2006BAD01A12-09);农业部“948”项目(2010-Z9);农业部公益性行业科研专项(200903045)
摘    要:采用基因组步移技术克隆了大口黑鲈垂体特异性转录因子POU1F1启动子序列,该序列全长1 629 bp,预测存在4个八聚体转录因子1(Oct-1)结合位点和TATA框等基本转录元件,1个Homeobox转录因子结合位点和2个cAMP反应元件结合蛋白(CREB)结合位点。采用直接测序法研究发现,大口黑鲈POU1F1启动子序列的-18和-183两个位点存在SNPs,该两个突变位点只检测到A、B两种单倍型。对养殖群体进行不同单倍型的基因频率和生长关联分析,结果表明,单倍型A的等位基因频率为0.246,单倍型B的等位基因频率为0.754;群体关联分析表明,基因型为AA型和AB型的个体在体质量、体长、全长、体高和体宽等方面明显高于BB型个体,但基因型为AB型和AA型的个体之间在体质量方面没有明显差异。该研究结果为下一步进行分子标记辅助选择提供了基础。

关 键 词:大口黑鲈    垂体特异性转录因子    单核苷酸多态性(SNPs)    关联分析
收稿时间:2/11/2011 5:20:12 AM
修稿时间:4/1/2011 5:45:11 PM

Effects of SNPs in POU1F1 promoter on growth traits in largemouth bass(Micropterus salmoides)
DU Fang-fang,BAI Jun-jie,LI Sheng-jie,LI Xiao-hui and FAN Jia-jia.Effects of SNPs in POU1F1 promoter on growth traits in largemouth bass(Micropterus salmoides)[J].Journal of Fisheries of China,2011,35(6):793-800.
Authors:DU Fang-fang  BAI Jun-jie  LI Sheng-jie  LI Xiao-hui and FAN Jia-jia
Institution:Pearl river fishes institute of CAFS
Abstract:
Keywords:
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