| 慢性密度胁迫对绿鳍马面鲀肌肉转录组的影响 |
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| 引用本文： | 程起群,段晓晨,宋丹.慢性密度胁迫对绿鳍马面鲀肌肉转录组的影响[J].水产科技情报,2024(1):29-37. |
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| 作者姓名： | 程起群 段晓晨 宋丹 |
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| 作者单位： | 中国水产科学研究院东海水产研究所 |
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| 基金项目： | 上海市自然科学基金项目(19ZR1470100)； |
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| 摘 要： | 为了解慢性密度胁迫下绿鳍马面鲀(Thamnaconus septentrionalis)肌肉组织的分子响应机制，挖掘密度胁迫下的相关信号通路和差异表达基因，设置2个养殖密度组(即100尾/m3的中密度组和500尾/m3的高密度组)对绿鳍马面鲀肌肉转录组进行了研究。分别于第25天和第50天时获得养殖绿鳍马面鲀的肌肉组织，利用Illumina测序平台对肌肉组织样本进行了转录组测序，得到103.3 Gb高质量测序数据。对照开始时暂养的绿鳍马面鲀，各试验组均筛选出大量的差异表达基因。通过GO(Gene Ontology)功能注释与KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)功能富集分析，筛选出涉及破骨细胞分化、MAPK、PI3K-Akt等路径以及黏着斑相关的信号传导机制，发现nfatc1、tgfbr2、map3k14、pparg、fos、flna、flnc、fn1、tln1、thbs1等关键基因在绿鳍马面鲀肌肉组织中的差异性表达。研究表明，这些差异表达基因可能在调节绿鳍马面鲀的细胞生长和分化、免疫能力等方...
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| 关 键 词： | 密度胁迫 基因表达 转录组 绿鳍马面鲀 养殖 |
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