魁蚶(Scapharca broughtonii)不同地理群体的遗传多样性及种群结构 |
| |
作者姓名: | 刘寒苗 吴 彪 刘志鸿 杨爱国 周丽青 孙秀俊 |
| |
作者单位: | 农业部海洋渔业可持续发展重点实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛 266071;上海海洋大学水产与生命学院 上海 201306,农业部海洋渔业可持续发展重点实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛 266071,农业部海洋渔业可持续发展重点实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛 266071,农业部海洋渔业可持续发展重点实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛 266071,农业部海洋渔业可持续发展重点实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛 266071,农业部海洋渔业可持续发展重点实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛 266071 |
| |
摘 要: | 采用PCR技术扩增了中国山东胶南、长岛、蓬莱、荣成和韩国统营5个地理群体魁蚶(Scapharca broughtonii)样本的COⅠ、12S rRNA、18S rRNA和28S rRNA基因部分序列,分析了魁蚶5个地理群体的遗传多样性和系统进化关系。经测序拼接、剪接后,分别获得67条776 bp的COⅠ序列、72条443 bp的12S rRNA序列、75条909 bp的18S rRNA序列和75条894 bp的28S rRNA序列。序列分析结果显示,5个群体75个个体的COⅠ序列中共检测到466个多态位点,32种单倍型,单倍型多样性指数为0.925,核苷酸多样性指数为0.086;12S rRNA序列中共检测到292个多态位点,43种单倍型,单倍型多样性指数是0.928,而核苷酸多样性为0.0856;在18S rRNA序列中,5个群体都表现出丰富的遗传多样性,共有74种单倍型,909个多态位点,单倍型多样性指数为1.0,核苷酸多样性指数为0.717,其中胶南群体变异位点最多、多样性最丰富;通过对28S rRNA部分序列的分析发现,75个个体共检测到27个多态位点,18种单倍型,单倍型多样性指数为0.778,核苷酸多样性指数为0.289,蓬莱群体多样性最丰富。遗传距离分析结果表明,韩国群体与其他4个群体的遗传距离较大;基于COⅠ序列的系统进化树显示有多个聚群。
|
关 键 词: | 魁蚶 COⅠ基因 12S rRNA基因 18S rRNA基因 28S rRNA基因 遗传多样性 |
收稿时间: | 2016/9/6 0:00:00 |
修稿时间: | 2016/10/18 0:00:00 |
Genetic Diversity and Geographic Population Structures of Scapharca broughtonii |
| |
Authors: | LIU Hanmiao WU Biao LIU Zhihong YANG Aiguo ZHOU Liqing and SUN Xiujun |
| |
Abstract: | |
| |
Keywords: | |
|
| 点击此处可从《》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《》下载免费的PDF全文 |