| 缢蛏Toll样受体家族基因全基因组水平鉴定及其在弧菌刺激下的表达分析 |
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| 作者姓名： | 杜博博 姚璐 李治平 董迎辉 任建峰 |
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| 作者单位： | 上海海洋大学 科技部海洋生物科学国际联合研究中心 上海 201306; 上海海洋大学 水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室 上海 201306;上海海洋大学 科技部海洋生物科学国际联合研究中心 上海 201306; 上海海洋大学 水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室 上海 201307;上海海洋大学 科技部海洋生物科学国际联合研究中心 上海 201306; 上海海洋大学 水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室 上海 201308;浙江万里学院生物与环境学院 浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验室 浙江 宁波 315000 |
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| 摘 要： | 缢蛏(Sinonovacula constricta)是我国传统的四大海水养殖贝类之一，养殖过程中易受病原菌感染而造成大量死亡和经济损失。Toll样受体(Toll-like receptor, TLR)是目前研究最多的模式识别受体，在无脊椎动物的先天性免疫中发挥着重要作用。研究缢蛏TLR分子特征及其免疫功能对预防和控制病原菌感染至关重要。本研究从缢蛏基因组序列中鉴定出42个TLR基因(ScTLR)，其中，33个编码典型的TLR蛋白，其他9个为TLR样蛋白。根据蛋白结构域特点，将典型的TLR蛋白分为2大类4个亚类，一类为多半胱氨酸簇TLR (mccTLR)，包括1个P型TLR和7个sPP型TLR；另一类为单半胱氨酸簇TLR (sccTLR)，包括16个sP型TLR和9个Ls型TLR。与其他9种软体动物TLR基因的类型和数目比较结果显示，缢蛏基因组中未发现其他软体动物中存在的V型和Twin-TIR型TLR，起源古老的mccTLR类群在软体动物中没有大规模的扩张，而起源较晚的sccTLR类群却发生了大规模的扩张。荧光定量PCR分析显示，6种ScTLR在检测的7种组织中普遍表达，且在血细胞、鳃和肝胰腺组织中高表达。最后，副溶血弧菌(Vibrio parahemolyticus)胁迫12 h和48 h的缢蛏鳃和肝胰腺转录组数据分析显示，副溶血弧菌感染前后9个TLR基因在鳃或肝胰腺中的表达量发生显著变化，6个基因(ctg118.25、ctg118.26、ctg356.25、ctg774.6、ctg681.6和ctg1513.5)在感染12 h或48 h后的鳃组织中表达差异显著，前5个基因表达量上调，仅ctg1513.5表达量下调；3个基因(ctg467.9、ctg2496.3和ctg903.17)在感染12 h或48 h后的肝胰腺中表达差异显著，其中，ctg467.9和ctg2496.3表达量下调，ctg903.17表达量上调。综上所述，本研究结果将为深入探讨不同TLR基因在缢蛏天然免疫中发挥的作用提供研究基础。
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| 关 键 词： | 缢蛏 Toll样受体 弧菌刺激 表达分析 |
| 收稿时间： | 2022/3/3 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2022/4/11 0:00:00 |
Genome-wide identification of Toll-like receptor family genes in Sinonovacula constricta and their expression in response to Vibrio parahemolyticus infection |
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| Authors: | DU Bobo YAO Lu LI Zhiping DONG Yinghui REN Jianfeng |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Sinonovacula constricta Toll-like receptors Vibrio challenge Expression analysis |
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