| 缢蛏ABC转运蛋白基因家族成员全基因组鉴定及表达模式分析 |
| |
| 作者姓名： | 杨凡 李治平 董迎辉 任建峰 |
| |
| 作者单位： | 上海海洋大学 科技部海洋生物科学国际联合研究中心 上海 201306；上海海洋大学 水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室 上海 201306;浙江万里学院生物与环境学院 浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验室 浙江 宁波 315000 |
| |
| 基金项目： | 国家重点研发计划“蓝色粮仓科技创新”专项(2018YFD0901405)； |
| |
| 摘 要： | 腺苷三磷酸结合盒转运蛋白(ATP binding cassette transporter,ABC transporter)家族是最古老的膜蛋白家族之一，广泛存在于原核生物和真核生物体内，利用ATP水解释放的能量对氨基酸、脂质、抗生素等物质进行跨膜运输，参与生物体内多种生理活动。目前，对软体动物ABC转运蛋白家族的鉴定，仅在虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)、栉孔扇贝(Chlamys farreri)和长牡蛎(Crassostrea gigas) 3种双壳类中有系统研究，对缢蛏(Sinonovacula constricta) ABC转运蛋白家族的鉴定和表达模式分析尚未见报道。利用缢蛏基因组和转录组数据，运用本地及NCBI在线BLAST程序、FGENESH+、SMART、Ex PASy、MEGA X、Mev 4.90和MapInspect等生物信息学分析工具，在全基因组水平系统地鉴定出52个缢蛏ABC转运蛋白，并对转运蛋白基因外显子数目、染色体定位等信息进行分析；通过系统进化分析，将缢蛏ABC转运蛋白家族分为8个亚家族，即ABCA～ABCH；通过比较分析不同物种...
|
| 关 键 词： | 缢蛏 ABC转运蛋白 序列分析 表达模式 |
| 收稿时间： | 2022/8/4 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2022/11/2 0:00:00 |
Genome-wide identification and expression pattern of ABC transporters in razor clam (Sinonovacula constricta) |
| |
| Authors: | YANG Fan LI Zhiping DONG Yinghui REN Jianfeng |
| |
| Institution: | International Research Center for Marine Biosciences, Ministry of Science and Technology, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China; Key Laboratory of Exploration and Utilization of Aquatic Genetic Resources, Ministry of Education, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China;Key Laboratory of Aquatic Germplasm Resource of Zhejiang, College of Biological and Environmental Sciences, Zhejiang Wanli University, Ningbo 315000, China |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | Sinonovacula constricta ABC transporter Sequence analysis Gene expression pattern |
|
| 点击此处可从《》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《》下载免费的PDF全文 |
