牙鲆(Paralichthys olivaceus) Activin基因两种β亚基的启动子克隆及生物信息学分析 |
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作者姓名: | 刘蒙蒙 王 晶 高金宁 马丽曼 张全启 |
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作者单位: | 中国海洋大学海洋生命学院 海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室 青岛 266003,中国海洋大学海洋生命学院 海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室 青岛 266003,中国海洋大学海洋生命学院 海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室 青岛 266003,中国海洋大学海洋生命学院 海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室 青岛 266003,中国海洋大学海洋生命学院 海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室 青岛 266003 |
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基金项目: | 国家863计划课题(2012AA10A402; 2012AA10A408)资助 |
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摘 要: | 以牙鲆为研究对象,利用染色体步移(Genome walking)获得了Activin两个β亚基基因的上游部分启动子序列,并对其进行了转录调控元件的生物信息学预测分析。获得了Activin βA和βB两个亚基的启动子部分序列,长度分别约为2.7 kb和2.4 kb;在预测的Activin βB转录起始位点(+1位)的上游31 bp处有1个典型的TATA box,而在Activin βA中未发现TATA box的存在。两个基因的启动子上发现了多个转录因子Sp1、Oct-1、C/EBP、CREB、GATA-1、HNF-3、HNF-1、USF等结合位点,还发现了与内分泌相关的Pit-1、ER、PR、GR、RAR、RXR等结合位点,但肌性转录因子MyoD、myogenin和雄性的性别决定基因SRY结合位点仅在Activin βA启动子中发现。生物信息学分析显示,牙鲆Activin βA和βB表达受到多种潜在因子的调控,二者在调控上有所差异。
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关 键 词: | 牙鲆 激活素 启动子 生物信息学分析 |
收稿时间: | 2014/4/10 0:00:00 |
修稿时间: | 2014/6/24 0:00:00 |
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