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| 半滑舌鳎IRF-7基因的全长cDNA克隆及表达分析 | |
| 作者姓名： | 刘万建 史成银 宋展 耿伟光 李赟 黄倢 |
| 作者单位： | 1. 中国海洋大学教育部 海水养殖重点实验室,青岛266003;农业部海洋渔业可持续发展重点实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所,青岛266071 2. 农业部海洋渔业可持续发展重点实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所,青岛,266071 3. 山东理工大学,淄博,255049 4. 中国海洋大学教育部 海水养殖重点实验室,青岛,266003 |
| 基金项目： | 中国水产科学研究院基本科研业务费，国家重点基础研究发展计划课题 |
| 摘 要： | 本研究克隆了半滑舌鳎干扰素调节因子7(CsIRF-7)cDNA的全长序列,并对该基因进行了结构特征分析,同时还完成了该基因在半滑舌鳎各组织中表达水平的定量分析.结果表明,CsIRF-7基因cDNA全长为1 957 bp,其中包含48 bp的5'-UTR、1 302 bp的ORF和607 bp的3'-UTR.CsIRF-7 cDNA编码一个由433个氨基酸残基组成的多肽.氨基酸序列比对结果表明,CsIRF-7多肽与脊椎动物IRF-7相似,存在高度保守的3个结构域:DNA结合域(DNA binding domain,DBD)、干扰素相关区(IRF associated domain,IAD)和丝氨酸富含区(Serine-rich domain,SRD).全长氨基酸序列同源性分析发现,CsIRF-7与硬骨鱼类的IRF-7同源性较高,与4种硬骨鱼类的同一性和相似性分别介于48.5％～73.6％和65.4％～83.8％之间；其中与牙鲆的同一性和相似性最高,分别为73.6％和83.8％；而与哺乳类和鸟类IRF-7的同源性较低,其同一性和相似性分别仅为30.3％～32.2％和46.5％～52.5％.系统进化分析表明,CsIRF-7与硬骨鱼类的IRF-7聚为一类,并与其他脊稚动物的IRF-7和IRF-3共同组成了脊椎动物IRF-3亚家族.实时荧光定量PCR检测结果显示,CsIRF-7基因在半滑舌鳎的肝、肾、脾、血细胞、鳃、肠和心脏等7种检测的组织中均有表达,在肠中表达量最高,而在肝、鳃和血细胞中表达量相对较少. |
| 关 键 词： | 半滑舌鳎 干扰素调节因子7 Poly Ⅰ:C 基因克隆 表达分析 |
| 收稿时间： | 2012/2/16 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2012/6/6 0:00:00 |
Molecular cloning and tissue expression of IRF-7 gene of Cynoglossus semilaevis |
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| Authors: | LIU Wan-jian SHI Cheng-yin SONG Zhan GENG Wei-guang LI Yun HUANG Jie |
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