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| 刺参基因组DNA甲基化水平及模式对温度变化的响应 | |
| 作者姓名： | 温争争 左闪 陈梦 周红学 孙国华 冯艳微 王卫军 杨建敏 |
| 作者单位： | 上海海洋大学 水产科学国家级实验教学示范中心 上海 201306；上海海洋大学 上海水产养殖工程技术研究中心 上海 201306；鲁东大学农学院 烟台 264025;山东省农业农村厅 济南 250013;鲁东大学农学院 烟台 264025；烟台海育海洋科技有限公司 烟台 264001 |
| 摘 要： | 本研究为了探讨刺参(Apostichopus japonicus)在不同温度胁迫下的DNA甲基化水平与甲基化模式变化，利用全基因组重亚硫酸盐测序技术(WGBS)和酶联免疫吸附法(ELISA)对刺参在3个温度下(20℃、26℃和32℃)的纵肌、呼吸树、消化道和体壁4个组织进行分析。WGBS测序结果显示，在消化道组织中，20℃、26℃和32℃温度组全基因组总甲基化水平分别为(1.70±0.01)%、(1.79±0.11)%和(1.59±0.04)%，26℃组处于休眠状态，刺参消化道基因组甲基化水平升高，而32℃组高温胁迫下，甲基化水平下降；在总甲基化位点中，CG类型是主要的甲基化修饰(96%以上)，CHH和CHG位点占比较低；30%甲基化水平的甲基化位点中，CHG和CHH为本类型甲基化的最高点，且显著高于CG类型。ELISA检测结果显示，3种不同温度下，刺参呼吸树和消化道组织的甲基化水平范围为2.68%~3.29%，均高于纵肌和体壁组织；温度变化后，刺参呼吸树和消化道组织的总甲基化水平均有显著变化，而纵肌和体壁的总甲基化水平基本不变，表明DNA甲基化可能参与刺参的高温胁迫调控机制。刺参应对温度变化过程中DNA甲基化水平的研究，从表观遗传学视角解析温度升高对刺参不同组织的影响，可为丰富刺参甲基化研究内容和无脊椎动物的甲基化发生规律提供参考。 |
| 关 键 词： | 刺参 DNA甲基化水平及模式 休眠 高温胁迫 全基因组重亚硫酸盐测序技术 酶联免疫吸附 |
| 收稿时间： | 2020/12/4 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2020/12/18 0:00:00 |
DNA methylation level of genomic DNA of Apostichopus japonicus at different temperatures |
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| Authors: | WEN Zhengzheng ZUO Shan CHEN Meng ZHOU Hongxue SUN Guohu FENG Yanwei WANG Weijun YANG Jianmin |
| Institution: | Shanghai Ocean University, National Demonstration Center for Experimental Fisheries Science Education, Shanghai 201306; Shanghai Ocean University, Shanghai Engineering Research Center of Aquaculture, Shanghai 201306; Ludong University, College of Agriculture, Yantai 264025;Department of Agriculture and Rural Affairs of Shandong Province, Jinan 250013;Ludong University, College of Agriculture, Yantai 264025; Yantai Haiyu Ocean Technology Co., Ltd, Yantai 264001 |
| Abstract: | |
| Keywords: | Apostichopus japonicus DNA methylation and mode Dormancy High temperature stress Whole genome bisulfite sequencing Enzyme linked immunosorbent assay |
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