| 4种鳕鱼线粒体16SrRNA、COI和Cytb基因片段序列的比较研究 |
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| 引用本文： | 毕潇潇,高天翔,肖永双,李永振.4种鳕鱼线粒体16SrRNA、COI和Cytb基因片段序列的比较研究[J].南方水产,2009,5(3):46-52. |
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| 作者姓名： | 毕潇潇 高天翔 肖永双 李永振 |
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| 作者单位： | 1. 中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室,山东,青岛,266003
2. 中国水产科学研究院南海水产研究所,广东,广州,510300 |
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划(863计划)，国家重点基础研究发展规划(973计划)，国家科技基础条件平台工作项目 |
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| 摘 要： | 对狭鳕(Theragra chalcogramma)、太平洋鳕(Gadus macrocephalus)、蓝鳕(Micromesistius poutassou)和远东宽突鳕(Eleginus gracilis)4种不同属鳕鱼的线粒体16S rRNA、Cytochrome oxidase subunit I(COI)和细胞色素b(Cyt b)基因片段序列进行了测定,分析比较了不同鳕鱼种间的序列差异.通过PCR扩增和序列测定,得到4种鳕鱼线粒体3个基因片段的总长度分别为539 bp(16S rRNA)、601 bp(COI)和385 bp(Cyt b),其基因片段的A+T含量都较高.4种鳕鱼种内个体间序列变异较小,3个基因片段的核苷酸替代速率依次为Cyt b＞ COI ＞16S rRNA.Cyt b 基因片段序列的分析结果显示太平洋鳕和狭鳕间分歧时间约为219万年,发生于中新世(Mio-cene);宽突鳕与蓝鳕间分歧时间约为653万年,发生在上新世(Pliocene).根据遗传距离构建的NJ系统树表明,狭鳕与太平洋鳕的亲缘关系较近,与蓝鳕的亲缘关系较远.
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| 关 键 词： | 鳕鱼 16SrRNA基因 COI基因 Cytb基因 序列分析 |
Sequence comparison of mtDNA 16S rRNA,COI and Cyt b gene fragments in four species of Gadidae fish |
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| BI Xiaoxiao,GAO Tianxiang,XIAO Yongshuang,LI Yongzhen.Sequence comparison of mtDNA 16S rRNA,COI and Cyt b gene fragments in four species of Gadidae fish[J].South China Fisheries Science,2009,5(3):46-52. |
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| Authors: | BI Xiaoxiao GAO Tianxiang XIAO Yongshuang LI Yongzhen |
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