| 叶尔羌高原鳅鳃组织TLRs基因家族成员鉴定及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 刘一萌,陈生熬,李瑶瑶,张庆杰,隋智海,张海光,全先庆,刘云国.叶尔羌高原鳅鳃组织TLRs基因家族成员鉴定及生物信息学分析[J].海洋渔业,2024(1):44-52. |
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| 作者姓名： | 刘一萌 陈生熬 李瑶瑶 张庆杰 隋智海 张海光 全先庆 刘云国 |
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| 作者单位： | 1. 临沂大学生命科学学院;2. 塔里木大学动物科学学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(32072979,31360635)； |
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| 摘 要： | 为探究叶尔羌高原鳅(Triplophysa yearkandensis)免疫系统中TLRs基因家族的多样性、进化关系和功能特征，基于该物种鳃组织的高通量二代转录组测序数据进行了生物信息学分析，在对该物种TLRs基因家族进行鉴定的基础上分析了其系统发育和蛋白功能。结果表明，叶尔羌高原鳅鳃组织中存在11个TLRs基因家族成员，分别为TLR1、TLR2、TLR3、TLR5、TLR7、TLR8、TLR9、TLR13、TLR18、TLR22和TLR25,其中TLR7、TLR9和TLR13缺失5′端序列，而其余序列均完整。TLRs基因家族成员系统发育分析发现，可以将11个基因分为5个亚家族。蛋白功能分析发现，各个TLR基因都含有富含亮氨酸重复结构域以及TIR结构域。物种间系统发育分析显示，叶尔羌高原鳅与西藏高原鳅(Triplophysa tibetana)和玫瑰高原鳅(Triplophysa rosa)在TLRs基因家族成员方面分别聚为一类，说明3个物种亲缘关系相近。研究结果有助于深入了解叶尔羌高原鳅TLRs基因家族的进化关系和免疫功能，同时也为该物种的遗传资源保护和养殖利用提供理论基础。
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| 关 键 词： | 叶尔羌高原鳅 TLR基因 基因家族 系统发育 |
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