| 栉孔扇贝转录组来源单核苷酸多态性位点的多态性分析 |
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| 引用本文： | 李玲,包振民,李纪勤,王师,张玲玲,陆维,胡晓丽.栉孔扇贝转录组来源单核苷酸多态性位点的多态性分析[J].水产科学,2012,31(12). |
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| 作者姓名： | 李玲 包振民 李纪勤 王师 张玲玲 陆维 胡晓丽 |
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| 作者单位： | 中国海洋大学 海洋生物遗传育种教育部重点实验室,山东 青岛,266003 |
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| 基金项目： | 现代农业产业技术体系建设专项资金资助项目，国家科技基础条件平台—水产种质资源平台;山东省农业良种工程 |
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| 摘 要： | 应用高分辨率熔解曲线技术对栉孔扇贝转录组来源的单核苷酸多态性位点进行验证分型和多态性分析.根据栉孔扇贝转录组单核苷酸多态性位点序列信息,对其中150个位点设计引物和探针,在4个栉孔扇贝野生群体中进行验证分型.其中,103对引物扩增出目的产物,76个位点成功分型,58个多态位点中51个是二等位多态性单核苷酸多态性(34.0％).进一步在荣成野生群体中对51个二态单核苷酸多态性位点进行多态性验证和群体遗传学分析,其中49个位点呈现多态性,且均为二态,最小等位基因频率为0.0610～0.5000,观测杂合度和期望杂合度分别为0.0833～0.8889和0.0833～0.5833.经Boferroni校正,有2个位点(C1630S115_AG和C19848S286_CA)在该群体中偏离Hardy-Weinberg平衡.各位点之间未检测到连锁不平衡.这些多态单核苷酸多态性位点可用于栉孔扇贝连锁图谱构建、分子标记辅助育种以及数量性状的基因定位等遗传学研究.
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| 关 键 词： | 单核苷酸多态性 分子标记 高分辨率熔解曲线 栉孔扇贝 |
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