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凤鲚ITS1与Cyt b基因序列的比较研究
引用本文:孙超,刘洪波,姜涛,杨健.凤鲚ITS1与Cyt b基因序列的比较研究[J].水产科学,2013(9).
作者姓名:孙超  刘洪波  姜涛  杨健
作者单位:1. 南京农业大学无锡渔业学院,江苏无锡,214081
2. 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心,中国水产科学研究院内陆渔业生态环境与资源重点开放实验室,江苏无锡 214081
3. 南京农业大学无锡渔业学院,江苏无锡 214081; 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心,中国水产科学研究院内陆渔业生态环境与资源重点开放实验室,江苏无锡 214081
基金项目:国家自然科学基金资助项目(30871920);中国水产科学研究院基本科研业务费专项课题(2012A0201).
摘    要:比较分析了分子标记核DNA ITS1序列和Cyt b基因序列在凤鲚遗传多样性分析和凤鲚与其他鲚属鱼类(以刀鲚为例)间亲缘关系研究中的特征。研究发现凤鲚其 ITS1序列的 GC 含量(71.19%)显著高于Cyt b基因序列(42.96%),ITS1序列的单倍型多样性(0.900)和核苷酸多样性(0.00997±0.01116)也显著高于Cyt b基因序列(0.400/0.000369±0.000469)。基于ITS1序列所得的凤鲚与刀鲚间的MCL和K2P遗传距离可明确区两种鲚属鱼类,与Cyt b基因序列的结果相一致。通过ML和UPGMA系统树的构建发现,凤鲚和刀鲚分别形成独立的分支。本研究显示ITS1序列与Cyt b基因序列所得结果一致性较好,可考虑将ITS1序列作为凤鲚的遗传多样性分析及其与其他鲚属鱼类间亲缘关系研究中有效的分子标记。

关 键 词:ITS1序列  Cyt  b基因序列  遗传多样性  凤鲚  亲缘关系

The Comparison of ITS1 and Cyt b Gene Sequences in Tapertail Anchovy Coilia mystus
SUN Chao , LIU Hongbo , JIANG Tao , YANG Jian.The Comparison of ITS1 and Cyt b Gene Sequences in Tapertail Anchovy Coilia mystus[J].Fisheries Science,2013(9).
Authors:SUN Chao  LIU Hongbo  JIANG Tao  YANG Jian
Abstract:
Keywords:ITS1 sequence  Cyt b gene sequence  genetic diversity  Coilia mystus  phylogenetic relationship
本文献已被 万方数据 等数据库收录!
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