| 菲律宾蛤仔GST基因家族的全基因组鉴定及急性盐度胁迫下的表达特征 |
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| 引用本文： | 蒋欣月,周丽青,孙秀俊,井浩,葛广玉,吴彪,刘志鸿.菲律宾蛤仔GST基因家族的全基因组鉴定及急性盐度胁迫下的表达特征[J].中国水产科学,2023(9):1055-1066. |
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| 作者姓名： | 蒋欣月 周丽青 孙秀俊 井浩 葛广玉 吴彪 刘志鸿 |
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| 作者单位： | 1. 中国水产科学研究院黄海水产研究所,农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室;2. 上海海洋大学,水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金面上项目(32273107)；;莆田市科技计划项目(2021NJJ002)； |
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| 摘 要： | 为阐明菲律宾蛤仔(Ruditapesphilippinarum)谷胱甘肽转移酶(glutathioneS-transferase,GST)基因(RpGST)家族特征及其在应对急性盐度变化中所起的作用,本研究通过生物信息学方法对RpGST基因家族进行了全基因组水平的鉴定、染色体定位、结构特征分析、进化分析和表达特征分析,共鉴定出7个RpGST基因家族成员,分别命名为RpGSTA1、RpGSTA2、RpGSTA3、RpGSTA4、RpGST＿C＿3a、RpGST＿N＿M1、RpGST＿N＿M2。RpGSTs不均匀地定位在5条染色体上,其编码蛋白的理化性质呈现出不同程度的亲水性。RpGST蛋白均定位于细胞质中,该基因家族成员都具有谷胱甘肽转移酶结构域(PF00043、PF02798),表明RpGSTs蛋白参与抗氧化和解毒过程;系统发育分析显示, RpGSTs分为3个亚家族且在进化上保守。实时荧光定量分析显示,急性盐度胁迫菲律宾蛤仔0 h、12 h和24 h后,急性高盐(40)胁迫下肝胰腺中RpGSTA和RpGST＿N＿M亚家族的基因整体表达水平随时间逐步升高,RpGST＿C＿3亚家族的基因表...
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| 关 键 词： | 菲律宾蛤仔 RpGST基因家族 急性盐度胁迫 表达模式 |
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