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圆斑星鲽MHC IIB基因结构、多态性及组织表达分析
引用本文:李宏俊,王娟,高祥刚,苏浩,刑坤,傅立元,赫崇波.圆斑星鲽MHC IIB基因结构、多态性及组织表达分析[J].中国水产科学,2011,18(2):299-307.
作者姓名:李宏俊  王娟  高祥刚  苏浩  刑坤  傅立元  赫崇波
作者单位:辽宁省海洋水产科学研究院辽宁省海洋水产分子生物学重点实验室;辽宁师范大学生命科学学院;大连海洋大学海洋工程学院;
基金项目:国家自然科学基金资助项目(30972246); 国家鲆鲽类产业技术体系计划项目(nycytx-50-S08); 国家海洋经济规划实施的科技推进平台与运行项目(2008-2009)
摘    要:通过表达序列标签法和cDNA末端快速扩增(RACE)技术,分离和克隆了圆斑星鲽(Verasper variegatus)主要组织相容性复合体(MHC)IIB的全长cDNA序列,该cDNA全长为1144bp,5'UTR(untranslated region)为7bp,3'UTR为450bp,开放阅读框(ORF)长度为687bp,可编码228个氨基酸,包含信号肽、抗原结合域(β1)、IGC区(β2)、跨膜区和胞质区5个结构域。同源分析表明,圆斑星鲽MHCIIB氨基酸序列与其他硬骨鱼具有49%~79%的同源性,与鼠、人、红原鸡和护士鲨的相似性较低,分别为34%、33%、31%和30%。圆斑星鲽MHC ⅡB基因含有5个内含子,与其他硬骨鱼不同,其β2结构域编码区内存在1个109bp的内含子。根据获得的MHC ⅡB基因组序列设计特异性引物,在10尾野生圆斑星鲽中扩增了包括完整内含子1和外显子2的长度约388bp的DNA片段,PCR产物直接测序后发现在270bp的抗原结合域中共有23个位点发生变异,密码子第1位和第2位的变异明显高于第3位。利用荧光定量PCR分析组织表达发现,MHCIIB基因在健康圆斑星鲽9种组织中均有...

关 键 词:圆斑星鲽  MHC  ⅡB  cDNA  基因结构  多态性  组织特性表达  
修稿时间:2011/3/9 0:00:00
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