| 河川沙塘鳢线粒体基因组重排机制及分子标记筛选 |
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| 引用本文： | 李强,刘至治,顾珈宁.河川沙塘鳢线粒体基因组重排机制及分子标记筛选[J].中国水产科学,2015,22(5):858-866. |
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| 作者姓名： | 李强 刘至治 顾珈宁 |
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| 作者单位： | 上海海洋大学 省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室, 上海 201306 |
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| 基金项目： | 上海市自然科学基金项目(14ZR1420400); 上海高校水产一流学科建设项目. |
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| 摘 要： | 采用引物步移法PCR扩增,获得全长为16846 bp的河川沙塘鳢(Odontobutis potamophila)线粒体全基因组DNA(mt DNA),并对其基因结构、重排机制及在系统发育中的应用进行了分析。研究结果:(1)河川沙塘鳢mt DNA由37个基因和1个非编码控制区组成;除ND6和8个t RNA外,其他基因都编码在重链(H)上;t RNA基因因发生滑移重排(shuffling),将经典的线粒体基因组HSL(t RNAHis–t RNASer–t RNALeu)排列变成了SLH(t RNASer–t RNALeu–t RNAHis)排列,造成在t RNALeu与t RNAHis、ND4与t RNASer之间分别插入了320 bp和42 bp的两个"匿名区"。(2)检测的112种鲈形目(Perciformes)鱼类中,仅有13种(11.61%)发生了mt DNA基因重排现象,而沙塘鳢属的中华沙塘鳢(O.sinensis)、平头沙塘鳢(O.platycephala)与河川沙塘鳢的基因重排位置一致,揭示其可能是沙塘鳢属鱼类进化过程中的一个重要分子"标签"。(3)筛选得到的两个分子标记ND4和ND5基因,适合用于虾虎鱼亚目(Gobioidei)鱼类科阶元水平的系统发育关系的重建。
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| 关 键 词： | 河川沙塘鳢 线粒体基因组 基因重排 分子标记 |
| 修稿时间： | 2015/11/7 0:00:00 |
Mitochondrial gene rearrangement and molecular marker selectionfor Odontobutis potamophila |
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| LI Qiang,LIU Zhizhi,GU Jianing.Mitochondrial gene rearrangement and molecular marker selectionfor Odontobutis potamophila[J].Journal of Fishery Sciences of China,2015,22(5):858-866. |
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| Authors: | LI Qiang LIU Zhizhi GU Jianing |
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| Institution: | Key Laboratory of Exploration and Utilization of Aquatic Genetic Resources, Ministry of Education, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Odontobutis potamophila mitochondrial genome gene arrangement molecular marker |
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