| 斑点叉尾 ipu-miR-143靶基因EB1的鉴定 |
| |
| 引用本文： | 唐刘秀,许志强,赵沐子,葛家春,潘建林.斑点叉尾 ipu-miR-143靶基因EB1的鉴定[J].中国水产科学,2014,21(2):283-290. |
| |
| 作者姓名： | 唐刘秀 许志强 赵沐子 葛家春 潘建林 |
| |
| 作者单位： | 1. 江苏省淡水水产研究所, 江苏 南京210017;2. 南京师范大学 生命科学学院, 江苏 南京210023 |
| |
| 基金项目： | 江苏省自然科学基金面上研究项目(BK2011864). |
| |
| 摘 要： | 采用生物信息学方法对斑点叉尾 (Ictalurus punctatus)ipu-miR-143的靶基因进行预测, 并对预测到的ipu-miR-143靶基因进行生物学鉴定。生物信息学预测结果显示, 斑点叉尾 微管相关蛋白基因RP/EB家族EB1基因的3′-UTR区具有ipu-miR-143的潜在作用位点。结合对几种近缘物种中RP/EB家族EB1基因和miR-143的进化保守性进行分析, 推测ipu-miR-143在斑点叉尾 中可以通过靶向EB1基因的3′-UTR区而发挥其调控功能。因此, 本研究将斑点叉尾 EB1基因的3′-UTR区(含有miR-143靶位点)构建到pMIR-REPORTTM Luciferase载体的下游, 通过双荧光素酶报告基因检测系统对ipu-miR-143的靶基因进行鉴定。采用HEK293和CCK两种细胞进行细胞转染, 两种细胞中转染miR-143 mimics组荧光相对活性与对照组相比均表现为显著性降低(P<0.05)。共转染miR-143 inhibitors后, CCK细胞中荧光素酶相对活性(8.27±1.02)与对照组相比(5.44±1.55)显著上调(P<0.05); HEK293细胞中荧光素酶相对活性(6.30±1.19)与对照组(4.26±0.84)相比有所上升, 但无显著性差异(P>0.05)。初步研究结果提示, miR-143可以通过靶向EB1基因的3′-UTR区而发挥其调控功能。本研究旨为后续深入研究斑点叉尾 EB1基因的转录后调控机制提供基础依据。
|
| 关 键 词： | 斑点叉尾 miR-143 EB1基因 靶基因 |
| 修稿时间： | 2015/7/16 0:00:00 |
Identification of EB1 as a novel target of ipu-miR-143 in channel catfish (Ictalurus punctatus) |
| |
| TANG Liuxiu,XU Zhiqiang,ZHAO Muzi,GE Jiachun,PAN Jianlin.Identification of EB1 as a novel target of ipu-miR-143 in channel catfish (Ictalurus punctatus)[J].Journal of Fishery Sciences of China,2014,21(2):283-290. |
| |
| Authors: | TANG Liuxiu XU Zhiqiang ZHAO Muzi GE Jiachun PAN Jianlin |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | Ictalurus punctatus miR-143 EB1 gene target gene |
|
| 点击此处可从《中国水产科学》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《中国水产科学》下载免费的PDF全文 |
|
