| 马氏珠母贝C1qDC基因家族成员的鉴定及表达分析 |
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| 引用本文： | 王菁,李桂英,林楷琪,刘付柏,李金凤,黄宝松,王忠良.马氏珠母贝C1qDC基因家族成员的鉴定及表达分析[J].中国水产科学,2022,29(1):1-12. |
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| 作者姓名： | 王菁 李桂英 林楷琪 刘付柏 李金凤 黄宝松 王忠良 |
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| 作者单位： | 广东海洋大学水产学院, 广东 湛江 524088 |
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| 基金项目： | 广东省自然科学基金面上项目(2019A1515011875)； 广东省省级科技计划项目(国际科技合作领域)(2019A050510044)； 国家级大学生创新创业训练计划项目(CXXL2020002, 201810566001, CXXL2018001)； 广东海洋大学 2019 年“冲一流”省财政专项资金建设项目； 广东海洋大学“南海学者计划”项目(2017 年度)； 广东海洋大学 2021 年度本科生创新团队项目(CXTD2021001). |
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| 摘 要： | 含 C1q 结构域蛋白(C1q domain containing, C1qDC)是经典补体途径的起始分子, 能够识别免疫复合物, 启动补体系统经典途径。本研究基于马氏珠母贝(Pinctada fucata)全基因组测序数据, 结合生物信息学方法对 C1qDC 基因进行了鉴定, 同时对其系统进化关系、序列结构、基序组成、染色体定位和基因家族成员的表达水平进行了分析。结果显示, 从马氏珠母贝全基因组数据中共鉴定出 285 个 C1qDC 基因; 根据系统进化关系聚集为 5 个亚类, 不均匀分布在 14 条染色体上; 所有 C1qDC 序列均含有保守基序 1。比较转录组数据分析显示, 在溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)攻毒 4 h 后, 马氏珠母贝 C1qDC 基因家族中有 56 个基因在血细胞中的表达水平发生了显著变化。其中, 上调表达基因 32 个, 下调表达基因 24 个。实时荧光定量 PCR 检测结果表明, 随机挑选的 8 个 C1qDC 基因的表达模式与转录组数据一致。本研究结果为进一步解析马氏珠母贝 C1qDC 基因的进化模式及其在贝类免疫应答中的调控作用提供了理论基础。
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| 关 键 词： | 马氏珠母贝 含 C1q 结构域蛋白 基因家族 表达模式 |
Identification and expression patterns of members of the C1qDC gene family in Pinctada fucata |
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| WANG Jing,LI Guiying,LIN Kaiqi,LIUFU Bai,LI Jinfeng,HUANG Baosong,WANG Zhongliang.Identification and expression patterns of members of the C1qDC gene family in Pinctada fucata[J].Journal of Fishery Sciences of China,2022,29(1):1-12. |
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| Authors: | WANG Jing LI Guiying LIN Kaiqi LIUFU Bai LI Jinfeng HUANG Baosong WANG Zhongliang |
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| Institution: | Fisheries College, Guangdong Ocean University, Zhanjiang 524088 , China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | |
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