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基于Cytb及AFLP标记探讨仿石鲈科及相关科属分子系统进化关系
引用本文:陈铭,范蔓桦,张癸新,李子博,李清清,李江涛,周萌,梁日深,林蠡.基于Cytb及AFLP标记探讨仿石鲈科及相关科属分子系统进化关系[J].中国水产科学,2021,28(7):832-844.
作者姓名:陈铭  范蔓桦  张癸新  李子博  李清清  李江涛  周萌  梁日深  林蠡
作者单位:仲恺农业工程学院动物科技学院, 广东 广州 510225 ;广东省水环境与水产品安全工程技术研究中心, 广东 广州 510225 ;广东省水禽健康养殖重点实验室, 广东 广州 510225 ;广州市水产病害与水禽养殖重点实验室, 广东 广州 510225
基金项目:国家自然科学基金项目(31802300); 广东省自然科学基金项目(2018A0303130104); 广东省科技计划项目(2017A040403060); 广东省重点领域研发计划项目(2019B020215001).
摘    要:为从分子水平澄清我国仿石鲈科(Haemulidae)鱼类分类争议, 研究测定分析了仿石鲈科及其相关科属共 66 种鱼类的线粒体 DNA 细胞色素 b (Cyt b)部分序列, 结合 AFLP 标记信息, 共同探讨仿石鲈科及相关争议科属系统分类关系。结果表明, 在 Cyt b 基因上, 66 种鱼类一致序列为 729 bp, 编码 243 个氨基酸; AFLP 图谱中, 6 对引物组合共得到 669 条清晰条带, 多态性条带 669 条, 多态性比率 100%。基于 Cyt b 基因利用最大似然法与 AFLP 标记基于 UPGMA 聚类法构建的系统进化树大致相同, 进化树上, (1)仿石鲈科鱼类主要形成石鲈亚科(Haemulinae)与胡椒鲷亚科(Plectorhynchinae)两大分支, 石鲈属(Pomadasys)、仿石鲈属(Haemulon)、异孔石鲈属(Anisotremus)等 7 个属聚为石鲈亚科分支, 胡椒鲷属(Plectorhinchus)、少棘胡椒鲷属(Diagramma)与矶鲈属(Parapristipoma) 3 个属聚为胡椒鲷亚科分支。(2)髭鲷属(Hapalogenys)与眶棘鲈属(Scolopsis)没有与仿石鲈科聚在一起, 髭鲷属独自形成一支, 眶棘鲈属与金线鱼科(Nemipteridae)聚为一支。(3)鯻科(Teraponidae)的种类也没有与仿石鲈科鱼类相聚, 鯻科与舵鱼科(Kyphosidae)、石鲷科(Oplegnathidae)存在更近的亲缘关系。对于仿石鲈科及相关科属的分类争议, 研究支持仿石鲈科分为石鲈亚科与胡椒鲷亚科两个亚科, 以及鯻科、眶棘鲈属、髭鲷属不应该归为仿石鲈科的观点。

关 键 词:仿石鲈科    系统分类    AFLP    细胞色素  b

Molecular phylogenetic relationships of Haemulidae species and related families/genera based on Cyt b and AFLP markers
Chen Ming,Fan Manhu,Zhang Guixin,Li Zibo,Li Qingqing,Li Jiangtao,Zhou Meng,Liang Rishen,Lin Li.Molecular phylogenetic relationships of Haemulidae species and related families/genera based on Cyt b and AFLP markers[J].Journal of Fishery Sciences of China,2021,28(7):832-844.
Authors:Chen Ming  Fan Manhu  Zhang Guixin  Li Zibo  Li Qingqing  Li Jiangtao  Zhou Meng  Liang Rishen  Lin Li
Abstract:
Keywords:
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