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胡麻-小麦轮作更替土壤的细菌群落多样性分析
引用本文:王立光,叶春雷,陈军,李进京,李静雯,罗俊杰.胡麻-小麦轮作更替土壤的细菌群落多样性分析[J].干旱地区农业研究,2021,39(5):84-89.
作者姓名:王立光  叶春雷  陈军  李进京  李静雯  罗俊杰
作者单位:甘肃省农业科学院生物技术研究所,甘肃 兰州 730070
基金项目:甘肃省农业科学院博士基金(2019GAAS29);甘肃省科技计划资助项目-自然科学基金(20JR5RA106);财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系资助项目(CARS\|14\|2\|23) ;国家自然科学基金(31660391);甘肃省农业科学院科技支撑计划(2018GAAS01);甘肃省农业科学院中青年基金(2017GAAS93;2019GAAS37;2020GAAS43)
摘    要:采集胡麻-小麦轮作更替土壤,分别为第一年胡麻种植土壤(TC1)、第二年小麦轮作土壤(TR)和第三年胡麻种植土壤(TC2),利用高通量测序技术对不同土壤细菌群落进行测定,旨在揭示胡麻-小麦轮作更替对土壤细菌群落结构和多样性的影响。结果表明,TC2根际土壤样本细菌OTU数目最多,为1778条,细菌群落丰度指数(Chao指数1700.02和Ace指数1689.03)最低,而细菌群落多样性指数中,shannon指数表现为TC1(6.51)TR(6.42)TC2(6.21),simpson指数表现为TC2(0.0088)TR(0.0049)TC1(0.0030),即随着更替年限而降低。3种不同土壤样本内共获得细菌33门,且优势菌门(相对丰度0.01)均为变形菌门(Proteobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)和绿湾菌门(Chloroflexi)等11个菌门,各优势菌门在各处理中所占的丰度存在差异。随着种植更替,变形菌门(TC1 31.65%, TR 24.52%, TC2 28.53%)和芽单胞菌门(TC1 8.04%, TR 5.41%, TC2 6.01%)丰度先降低再升高,酸杆菌门(TC1 19.36%, TR 26.13%, TC2 11.18%)和绿湾菌门(TC1 9.69%, TR 12.68%, TC2 10.53%)丰度先增加后降低,放线菌门(TC1 12.14%, TR 13.79%, TC2 22.82%)丰度逐渐增加。细菌群落β多样性分析显示,轮作使土壤细菌的群落结构与TC1保持较小差异,而后续胡麻种植使其发生较大变化。通过Tax4Fun法在更替土壤中检测到细胞新陈代谢、遗传信息加工和环境信息处理等基因功能。大部分功能基因在TR的丰度与TC1相近。这些结果说明,小麦轮作能降低土壤细菌多样性和细菌群落结构组成的改变程度,从而利于下茬胡麻的种植。

关 键 词:胡麻-小麦轮作  土壤细菌群落  高通量测序  多样性分析  Tax4Fun功能预测

Diversity analysis of soil bacterial community in oil flax\|wheat rotation system
WANG Liguang,YE Chunlei,CHEN Jun,Li Jinjing,LI Jingwen,LUO Junjie.Diversity analysis of soil bacterial community in oil flax\|wheat rotation system[J].Agricultural Research in the Arid Areas,2021,39(5):84-89.
Authors:WANG Liguang  YE Chunlei  CHEN Jun  Li Jinjing  LI Jingwen  LUO Junjie
Institution:Biotechnology Research Institute, Gansu Academy of Agricultural Sciences, Lanzhou, Gansu 730070, China
Abstract:
Keywords:oil flax\|wheat rotation  soil bacteria community  high\|throughput sequencing  diversity analysis  Tax4Fun function prediction
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