| 羊口疮病毒ORFV113蛋白的主要特性及B细胞和T细胞抗原表位预测 |
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| 引用本文： | 李刚,龙琴琴,吴鹏,曾月娥,庞峰.羊口疮病毒ORFV113蛋白的主要特性及B细胞和T细胞抗原表位预测[J].贵州畜牧兽医,2023(5):45-48. |
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| 作者姓名： | 李刚 龙琴琴 吴鹏 曾月娥 庞峰 |
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| 作者单位： | 贵州大学动物科学学院 |
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| 基金项目： | “羊口疮病毒113基因的毒力功能研究”国家级大学生创新创业训练计划项目(202110657043)；;“基于ceRNA调控网络的ORFV114基因的毒力功能研究”贵州省科学技术基金(自然科学)(黔科合基础-ZK[2022]一般093)； |
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| 摘 要： | 为了预测羊口疮病毒ORFV113蛋白的主要特性及其优势B细胞和T细胞抗原表位，分别利用在线软件ProtParam预测ORFV113蛋白的理化性质，DeepTMHMM预测其跨膜区，SignalP 6.0预测其信号肽，SOPMA预测其二级结构，PSORT预测其亚细胞定位，ABCpred预测其优势B细胞表位，IEDB预测其优势细胞毒性T细胞表位。结果：ORFV113蛋白由208个氨基酸组成，为不稳定亲水性蛋白，分子质量约22.08 ku,理论等电点(PI)为4.36,在3～25 aa处存在1个跨膜区，不含信号肽，主要定位于细胞质膜；ORFV113蛋白的二级结构由延伸链(16.35%)、α-螺旋(23.08%)、β-转角(4.81%)、无规则卷曲(55.77%)组成；ORFV113蛋白存在11个优势B细胞表位，分别位于164～179 aa、62～77 aa、132～147 aa、120～135 aa、138～153 aa、101～116 aa、56～71 aa、188～203 aa、175～190 aa、49～64 aa、108～123 aa;存在3个优势T细胞表位，分别位于63～71 aa、...
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| 关 键 词： | 羊口疮病毒 ORFV113蛋白 蛋白特性 B细胞抗原表位 T细胞抗原表位 |
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