| 太行鸡CCNB2基因剪接异构体的克隆鉴定及其在卵泡发育中的表达模式分析 |
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| 引用本文： | 魏佳荣,张贝贝,马腾壑,李梦霄,李雪男,王斌,付冠华,王红娜,刘超.太行鸡CCNB2基因剪接异构体的克隆鉴定及其在卵泡发育中的表达模式分析[J].中国畜牧兽医,2022,49(10):3726-3735. |
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| 作者姓名： | 魏佳荣 张贝贝 马腾壑 李梦霄 李雪男 王斌 付冠华 王红娜 刘超 |
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| 作者单位： | 1. 河北工程大学生命科学与食品工程学院, 邯郸 056038;2. 河北工程大学医学院, 邯郸 056038;3. 河北天凯食品有限责任公司, 邢台 054100 |
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| 基金项目： | 河北省蛋肉鸡农业产业技术体系(2018YFD0501300);河北省科技厅项目(20326343D);河北省自然科学基金(C2020402003);河北省人社厅引进留学人员资助项目(C20190504);河北省高等学校科学技术研究项目(ZD2018071);邯郸市家禽工程技术创新中心(20312904034) |
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| 摘 要： | 【目的】试验旨在克隆鸡细胞周期素B2(cyclin B2,CCNB2)基因不同剪接异构体,并对其进行生物信息学和组织表达分析。【方法】采用反转录PCR技术对太行鸡CCNB2基因不同剪接异构体进行扩增和克隆,采用生物信息学软件对CCNB2基因不同剪接异构体的部分核苷酸序列进行比对,比较不同物种CCNB2不同剪接异构体的氨基酸序列相似性并构建系统进化树,对其进行亚细胞定位及二级结构预测。利用实时荧光定量PCR技术分析CCNB2基因不同剪接异构体在太行鸡卵巢和不同发育时期卵泡中的相对表达量。【结果】太行鸡CCNB2基因存在3种剪接异构体,即CCNB2-AS1、CCNB2-AS2和CCNB2-AS3,分别编码390、383和401个氨基酸。太行鸡CCNB2-AS1、CCNB2-AS2和CCNB2-AS3 3个剪接体之间的氨基酸序列相似性均为97.00％,这3个剪接体均与原鸡的相似性最高,分别为99.71％、99.71%和100％。3个剪接异构体在进化上与原鸡亲缘关系最近,其次为雉鸡。亚细胞定位结果表明,3个剪接异构体均主要定位于细胞质;蛋白质二级结构分析显示,3种剪接异构体均以α-螺旋为主;CCNB2-AS1、CCNB2-AS2和CCNB2-AS3在太行鸡不同发育时期卵泡中的相对表达量存在差异,并且不同剪接异构体在同一时期卵泡中的表达趋势也存在差异,其中CCNB2-AS1在等级前卵泡中高表达;而CCNB2-AS2在大白卵泡中表达量显著高于其他时期(P＜0.05),且在其他时期均以较低水平表达;CCNB2-AS3的表达则与CCNB2-AS1呈现相反的表达趋势,在等级卵泡中高表达。【结论】本研究成功鉴定到太行鸡CCNB2基因的3种剪接异构体,其在各时期卵泡中均有表达,但在等级前卵泡中的表达趋势存在差异。
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| 关 键 词： | 太行鸡 CCNB2基因 剪接异构体 生物信息学分析 组织表达 |
| 收稿时间： | 2022-04-11 |
Cloning and Identification of Splice Isoforms of CCNB2 Gene and Their Expression Patterns in Follicular Development in Taihang Chickens |
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| WEI Jiarong,ZHANG Beibei,MA Tenghe,LI Mengxiao,LI Xuenan,WANG Bin,FU Guanhua,WANG Hongna,LIU Chao.Cloning and Identification of Splice Isoforms of CCNB2 Gene and Their Expression Patterns in Follicular Development in Taihang Chickens[J].China Animal Husbandry & Veterinary Medicine,2022,49(10):3726-3735. |
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| Authors: | WEI Jiarong ZHANG Beibei MA Tenghe LI Mengxiao LI Xuenan WANG Bin FU Guanhua WANG Hongna LIU Chao |
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| Institution: | 1. College of Life Sciences and Food Engineering, Hebei University of Engineering, Handan 056038, China;2. College of Medicine, Hebei University of Engineering, Handan 056038, China;3. Hebei Tiankai Food Company of Limited Liability, Xingtai 054100, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Taihang chickens CCNB2 gene splicing isoforms bioinformatics analysis tissue expression |
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