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| 兔出血症病毒CD株衣壳蛋白(VP60)基因的克隆、核酸及氨基酸序列比较分析 | |
| 引用本文： | 向华,宣华,王文成,李尚波,魏广森.兔出血症病毒CD株衣壳蛋白(VP60)基因的克隆、核酸及氨基酸序列比较分析[J].中国兽医学报,2004,24(4):323-326. |
| 作者姓名： | 向华 宣华 王文成 李尚波 魏广森 |
| 作者单位： | 1. 解放军军需大学,军事兽医系,吉林,长春,130062 2. 辽宁省益康生物制品厂,辽宁,辽阳,111000 3. 辽宁省动物防疫站,辽宁,沈阳,110161 |
| 基金项目： | 吉林省科委资助项目 ( 2 0 0 3 0 5 5 7) |
| 摘 要： | 以兔出血症病毒 CD株人工感染家兔 ,发病死亡后 ,取肝脏匀浆 ,用 Trizol试剂从匀浆上清中提取病毒 RNA。根据 Gen Bank已发表序列保守区设计并合成引物 ,采用 RT- PCR方法扩增了 RHDV衣壳蛋白 VP6 0基因。将所扩增片段克隆到 p MD18- T载体上 ,并进行了序列测定 ,测序结果表明 ,CD株 VP6 0基因全长 174 0 bp。该序列与已发表的其他分布于世界各地的 14株 RHDV序列进行了比较和基因进化树分析。无毒株与各强毒株之间的同源性为 85 .3%～86 .5 % ,强毒株间的同源性较高 ,为 92 .1%～ 10 0 %。根据进化树可把强毒株分为 2大群 ,一群为 CD株、Iowa2 0 0 0株、0 0 - 139株、99- 0 5株 ,其余的为另一群。进一步细分 ,还可以分为 4个亚群和 7个组。但毒株之间的地域性差异并不明显。同时根据 15株 RHDV VP6 0基因的核苷酸序列推导了其所编码的氨基酸序列 ,并进行氨基酸序列的比较和亲水性、柔性区、抗原性和表面结构的比较分析。结果显示 ,各毒株氨基酸之间的的同源性在 90 .5 %～ 10 0 %之间 ,其中无毒株与各强毒株之间的同源性为 90 .5 %～ 91.9% ,强毒株间的同源性在 95 %～ 10 0 %之间 ;氨基酸变异分析未发现突变造成的 VP6 0蛋白高级结构的根本性变化 |
| 关 键 词： | 兔出血症病毒 VP60 序列分析 |
| 文章编号： | 1005-4545(2004)04-0323-03 |
| 修稿时间： | 2003年5月15日 |
Cloning and Sequence Analysis of VP60 Gene of RHDV CD Strain |
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| XIANG Hua,XUAN Hua,WANG Wen-cheng,LI Shang-bo,WEI Guang-sen.Cloning and Sequence Analysis of VP60 Gene of RHDV CD Strain[J].Chinese Journal of Veterinary Science,2004,24(4):323-326. | |
| Authors: | XIANG Hua XUAN Hua WANG Wen-cheng LI Shang-bo WEI Guang-sen |
| Institution: | XIANG Hua~1,XUAN Hua~1,WANG Wen-cheng~2,LI Shang-bo~2,WEI Guang-sen~3 |
| Abstract: | The particles of rabbit heamorrhagic disease virus (RHDV) CD strain were extracted from liver of the rabbit that was infected with the CD strain.The capsid protein gene (VP60) was cloned into pMD18 T vector by RT-PCR.And the sequence of VP60 was identified.The VP60 gene sequences of other 14 RHDV strains were compared with that of the CD strain.Phylogenetic analysis of the sequences of the capsid protein genes indicated that the 15 RHDV strains could be divided into 2 groups,the nonpathogenic strain forms one group and the 14 pathogenic strains form another,and there were no distinct diversity among the strains of different origins.The amino acids of the 15 strains of RHDV VP60 genes were compared, and no fundamental changes were decteced in the predicted secondary structure between pathogenic and nonpathogenic RHDV strains in VP60. |
| Keywords: | RHDV VP60 sequence analysis |
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