| 4株H3N2亚型猪源流感病毒HA基因的序列测定与特性分析 |
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| 引用本文： | 李敏,向华,宣华.4株H3N2亚型猪源流感病毒HA基因的序列测定与特性分析[J].中国兽医学报,2009,29(11). |
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| 作者姓名： | 李敏 向华 宣华 |
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| 作者单位： | 1. 吉林大学,畜牧兽医学院,吉林,长春,130062;广东省农业科学院,广州兽医研究所,广东,广州,510640
2. 广东省农业科学院,广州兽医研究所,广东,广州,510640 |
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| 摘 要： | 从广东省不同猪场分离到4株H3N2亚型猪源流感病毒A/Swine/Guangdong/01/2004、A/Swine/Guang-dong/02/2004、A/Swine/Guangdong/03/2004、A/Swine/Guangdong/04/2004.根据GenBank公布的H3N2亚型猪源流感病毒的HA基因序列,设计1对引物,运用RT-PCR方法扩增四株病毒的HA基因,并进行测序和分析.同源性分析和遗传进化分析表明本实验的4株H3N2亚型SIV HA基因核苷酸序列同源性为99.8%～99.9%,在遗传进化树中均位于同一分支上.与参考毒株的比较分析表明,4个毒株与WHO推荐的2001-2004年北半球H3N2亚型流感疫苗株A/Moscow/10/99 HA基因的核苷酸序列同源性最高为99.4%～99.5%,4个毒株与A/Moscow/10/99 HA基因在遗传进化树中位于同一个小分支上.氨基酸序列比较发现,4个毒株HA基因裂解位点处的氨基酸序列均为PEKQTR↓G,4个毒株推导的氨基酸序列中均有11个糖基化位点,4个毒株HA蛋白226位受体结合位点(RBS)处氨基酸均为异亮氨酸(Ⅰ).4个毒株HA基因的氨基酸序列、受体结合位点以及糖基化位点均与A/Moscow/10/99相应的氨基酸序列一致.本试验的4株H3N2亚型猪源流感病毒的HA基因属于以A/Moscow/10/99为代表的近代类人H3N2亚型流感病毒,在一定程度上揭示了广东省H3N2亚型猪流感病毒HA基因进化与流行情况.
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| 关 键 词： | 猪流感 H3N2亚型 HA基因 序列测定与分析 |
HA gene sequencing and analysis of four strains H3N2 Subtype swine influenza virus |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | swine influenza virus H3N2 HA sequencing and analysis |
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