| 羊传染性脓疱病毒NZ2毒株CBP蛋白结构分析与表位预测 |
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| 引用本文： | 成伟伟,陈伯祥,常攀峰,杨明,赵子惠.羊传染性脓疱病毒NZ2毒株CBP蛋白结构分析与表位预测[J].中国动物检疫,2019,36(12):76-82. |
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| 作者姓名： | 成伟伟 陈伯祥 常攀峰 杨明 赵子惠 |
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| 基金项目： | 甘肃省重点研发计划项目（18YF1NA021） |
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| 摘 要： | 本研究应用生物信息学方法,以ORFV NZ2毒株的CBP蛋白氨基酸序列为研究对象,对CBP蛋白的理化特性、亲水性、跨膜区、信号肽、二级结构、三级结构、B细胞表位和T细胞表位进行了预测分析。结果显示,CBP蛋白的相对分子质量为31.179 89 kDa,理论等电点为4.68,半衰期为30 h,稳定系数为43.06,脂肪族指数为81.78,总平均亲水性为-0.383。CBP蛋白为亲水性蛋白,无跨膜区,不属于跨膜蛋白,存在信号肽;二级结构中α螺旋、β折叠、β转角、无规卷曲分别占38.11%、33.91%、5.94%和10.48%,三级结构形似倒立的哑铃,上下对称。筛选出了6个优势B细胞表位、3个CTL细胞表位,无Th细胞表位。CBP蛋白为亲水性膜外蛋白,细胞表位较少,在细胞膜外为ORFV逃避宿主免疫反应发挥作用。本研究为CBP蛋白的功能研究与ORFV的致病机制研究提供了理论依据。
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| 关 键 词： | 羊传染性脓疱病毒 CBP蛋白 生物信息学 结构分析 表位预测 |
Structural Analysis and Epitope Prediction of CBP of ORFV NZ2 Strain |
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| Cheng Weiwei,Chen Boxiang,Chang Panfeng,Yang Ming,Zhao Zihui.Structural Analysis and Epitope Prediction of CBP of ORFV NZ2 Strain[J].China Journal Of Animal Quarantine,2019,36(12):76-82. |
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| Authors: | Cheng Weiwei Chen Boxiang Chang Panfeng Yang Ming Zhao Zihui |
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