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6株牛传染性鼻气管炎病毒BICP4基因序列的同源性分析
引用本文:李继昌,童光志,仇华吉,薛强,周艳君.6株牛传染性鼻气管炎病毒BICP4基因序列的同源性分析[J].中国预防兽医学报,2003,25(2):92-95.
作者姓名:李继昌  童光志  仇华吉  薛强  周艳君
作者单位:1. 东北农业大学,黑龙江,哈尔滨,150030
2. 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所生物技术室,黑龙江,哈尔滨,150001
摘    要:牛传染性鼻气管炎病毒的立即早期启动基因IER4.2编码感染细胞蛋白BICP4基因。各种疱疹病毒的BICP4基因的Ⅰ,Ⅲ,Ⅴ区变异性较大,并为其特征区。为了比较分离自不同牛种,不同部位的5种病毒株BICP4蛋白I区基因的差异性,本文根据已发表的IBBV K22毒株重复序列IRs中BICP4的基因序列设计了一特异性引物,对各毒株进行PCR扩增,均得到约540bp的片段,将其克隆,测序并连同K22株进行同源性比较。结果表明,6株病毒的核苷酸序列及氨基酸序列同源性均在98%以上,说明这些毒株重复序列中的早期基因高度保守,在一定程度上也显示出IBRV的高度保守性。

关 键 词:牛传染性鼻气管炎病毒  BICP4基因  重复序列  同源性分析
文章编号:1008-0589(2003)02-0092-04
修稿时间:2002年7月22日

Homology Analysis of the Partial Inverted Repeats of Six IBRV Strains
Abstract:According to the published IRs repeat sequence of IBRV strain K22,a pair of primers were designed and synthesized.DNAs from five strains of different origins were amplifed by PCR,a unique DNA fragment of about 540bp was obtained and cloned into pMD18_T veteor.Both the nucleotide sequences and amino acid sequences were comparied with those of K22 strain.It was showed that the homology of the nucleotide and the deduced amino acid sequence of the six stains were more than 98%.
Keywords:Infectious bovine rhinotracheitis virus(IBRV)  Inverted repeats  Homology analysis
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