猪乙脑病毒WHe株的PrM-E、NS1、E-NS2A基因的克隆及序列测定 |
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引用本文: | 乔宪凤,熊东海,郑新民,徐涤平,赵浩斌,魏庆信.猪乙脑病毒WHe株的PrM-E、NS1、E-NS2A基因的克隆及序列测定[J].中国预防兽医学报,2003,25(3). |
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作者姓名: | 乔宪凤 熊东海 郑新民 徐涤平 赵浩斌 魏庆信 |
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作者单位: | 1. 湖北省农业科学院,湖北,武汉,430064 2. 华中农业大学,湖北,武汉,430070 |
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基金项目: | 湖北省科技攻关项目,湖北省农业科学院科研项目 |
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摘 要: | 本文通过RT-PCR扩增了猪乙型脑炎病毒WHe株主要抗原基因NS1(约1.14 kb)、prM-E(约2.1 kb)、E-NS1-NS2A (约3.0 kb),并将NS1、E-NS1-NS2A、PrM-E基因克隆、测序.与Genbank发表的JEV基因序列进行序列分析,发现WHe株与其他12种典型的JEV强毒株的同源性在88.3 %~99.4 %之间.WHe株与K94P05株的同源性最低(88.3 %),与P3株的同源性最高(99.4 %),可认为WHe株是由P3株衍生而来的.在JEV基因组5'端389~3910的长3522 nt的决定JEV抗原性的C-prM-E-NS1-NS2A区中,WHe株与P3株仅有21个碱基不同,其中的14个单碱基突变为同义突变,另外7个为错义突变,导致相应的氨基酸序列(1173个)中的6个氨基酸发生了变异,其中的5个氨基酸变异出现在含有各关键的抗体中和决定簇的E蛋白内,另一个位于NS1蛋白内.
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关 键 词: | 日本乙型脑炎病毒 NS1、prM-E、E-NS1-NS2A 基因 基因克隆 核酸序列 |
Cloning and sequencing of NS1、prM-E、E-NS1-NS2A genes of pig Japanese encephalitis virus(WHe) |
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