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PRRSV流行株Nsp2、ORF5和ORF3基因序列的分析
引用本文:王旭荣,张彩勤,赵炳武,张春红,杨增岐,宋长绪.PRRSV流行株Nsp2、ORF5和ORF3基因序列的分析[J].动物医学进展,2008,29(12).
作者姓名:王旭荣  张彩勤  赵炳武  张春红  杨增岐  宋长绪
作者单位:1. 广东省农业科学院兽医研究所,广东,广州,510640;中国农业科学院,兰州畜牧与兽药研究所,甘肃,兰州,730050;西北农林科技大学,陕西,杨陵,712100
2. 广东省农业科学院兽医研究所,广东,广州,510640;西北农林科技大学,陕西,杨陵,712100
3. 广东省农业科学院兽医研究所,广东,广州,510640;北京必威安泰生物有限公司,内蒙古,呼和浩特,010018
4. 广东省农业科学院兽医研究所,广东,广州,510640
5. 西北农林科技大学,陕西,杨陵,712100
基金项目:国家食品安全重大专项项目(2001BA804A31);;广东省农业科技攻关项目(2003B21404、20052490100和2006B20301013);;广东省自然科学基金项目(04002083);;广东省自然基金重点项目(06105311)
摘    要:采用RT-PCR方法扩增2006年--2007年从江西、湖南、海南、广东等4省的不同猪场病猪体内分离的11株猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行株的Nsp2、ORF5和ORF3基因,并进行序列分析。结果表明,11个PRRSV流行株的Nsp2均发生30个氨基酸的不连续缺失,缺失位置与JXA1毒株相同;11个PRRSV流行株的ORF5、ORF3基因和JXA1相应序列的核苷酸同源性分别为99.2%~99.8%、99.1%~99.6%,氨基酸同源性分别为98.0%~99.5%、98.4%~99.6%;11个PRRSV流行株之间ORF5基因的核苷酸同源性和氨基酸同源性分别为98.8%~100.0oA、98.0oA~100.0%,其中5个流行株的ORF3基因的核苷酸和氨基酸同源性分别为99.0%~99.6%、98.8%~99.69,6。根据Nsp2所建立的遗传系统发育树可知这11个PRRSV流行株与JXA1株的亲缘关系很近。

关 键 词:猪繁殖与呼吸综合征病毒  Nsp2  ORF5  ORF3  序列分析

Nsp2, ORF5 and ORF3 Gene Sequence Analyses of PRRSV Isolate strains
WANG Xu-rong,ZHANG Cai-qin,ZHAO Bing-wu,ZHANG Chun-hong,YANG Zeng-qi,SONG Chang-xu.Nsp2, ORF5 and ORF3 Gene Sequence Analyses of PRRSV Isolate strains[J].Progress In Veterinary Medicine,2008,29(12).
Authors:WANG Xu-rong  ZHANG Cai-qin  ZHAO Bing-wu  ZHANG Chun-hong  YANG Zeng-qi  SONG Chang-xu
Institution:1.Institute of Veterinary Medicine;Guangdong Academy of Agricultural Sciences;Guangzhou;Guangdong;510640;China;2.Institute of Animal Husbandry and Veterinary Drugs;China Academy of Agricultural Sciences;Lanzhou;Gansu;730050;3.College of Veterinary Medicine;Northwest A & F University;Yangling;Shaanxi;712100;4.Beijing Biweiantai Biological Co.LTD;Hohhot;Inner Monogolia;010018;China
Abstract:11 PRRSV isolates newly were isolated from nosopoietic pigs in Jiangxi,Hunan,Hainan and Guangdong provinces respectively.The sequence analyses of Nsp2,ORF3 and ORF5 showed that these isolates had a discontinuous deletion of 30 amino acids in Nsp2.The ORF5 and ORF3 of 11 PRRSV isolates shared 99.2%-99.8% and 99.1%-99.6% nucleotide homologies,and 98.0%-99.5%,98.4%-99.6% amino acid homologies with that of JXA1,respectively.The ORF5 of 11 PRRSV isolates shared 99.0%-100.0%,nucleotide homologies and 98.0%-100.0%...
Keywords:Porcine reproductive and respiratory syndrome  isolate  NSP2  ORF3  ORF5  sequence analysis  
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