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一株H1N1亚型猪流感病毒全基因克隆及遗传特性分析
引用本文:孟慧芝,孙涛,岳志芹,王文斌.一株H1N1亚型猪流感病毒全基因克隆及遗传特性分析[J].动物医学进展,2015,36(6).
作者姓名:孟慧芝  孙涛  岳志芹  王文斌
作者单位:1. 山东出入境检验检疫技术中心,山东青岛266000;山西农业大学,山西太谷030801
2. 山东出入境检验检疫技术中心,山东青岛,266000
3. 山西农业大学,山西太谷,030801
摘    要:为快速获知流感病毒的全基因组序列,及时得知其遗传演化特性。设计11对通用条形码引物,采用RT-PCR法扩增A\swine\Shandong\01\2009(H1N1)株的8个基因节段,进行克隆测序和遗传进化分析。核酸序列测定结果显示,全基因组序列完整无缺失,但是基因组内2个位点突变导致PB1-F2、NS-1蛋白表达不完整,HA切割位点处氨基酸序列PSIQSR/GLF,无多个连续的碱性氨基酸,符合非致病性切割位点的特征。从绘制的各个片段进化树分析,此毒株与11株近5年在人和猪中流行的H1N1相似度高,HA的同源性达98.1%~99.7%,NA同源性98.6%~99.8%,与2009年暴发的A型H1N1流行株A/California/07/2009(H1N1)8个片段进行比对,核酸同源性高达99.1%~99.6%。

关 键 词:猪流感病毒  H1N1  全基因组测序  特异位点分析

Cloning and Genetic Characteristics Analysis of H1N1 SIV Genome
MENG Hui-zhi,SUN Tao,YUE Zhi-qin,WANG Wen-bin.Cloning and Genetic Characteristics Analysis of H1N1 SIV Genome[J].Progress In Veterinary Medicine,2015,36(6).
Authors:MENG Hui-zhi  SUN Tao  YUE Zhi-qin  WANG Wen-bin
Abstract:
Keywords:
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