| 绵羊全基因组ROH检测及候选基因鉴定 |
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| 引用本文： | 刘家鑫,魏霞,邓天宇,谢锐,韩建林,杜立新,赵福平,王立贤.绵羊全基因组ROH检测及候选基因鉴定[J].畜牧兽医学报,2019(8). |
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| 作者姓名： | 刘家鑫 魏霞 邓天宇 谢锐 韩建林 杜立新 赵福平 王立贤 |
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| 作者单位： | 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所农业部动物遗传育种与繁殖(家禽)重点实验室 |
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| 摘 要： | 旨在利用长纯合片段(runs of homozygosity,ROH)信息评估不同绵羊群体的近交情况,并鉴定与绵羊经济性状相关的基因。本研究基于Illumina Ovine SNP50芯片对来自10个绵羊群体共440个个体进行全基因组ROH检测,统计ROH在不同绵羊群体中的数目、长度及频率,根据ROH计算基因组近交系数(F_(ROH)),并对高频ROH区域进行基因注释。结果,在10个绵羊群体中共检测到25 920个ROH片段,不同绵羊群体ROH的数目、长度、频率及分布存在明显差异。ROH平均数目的变化范围从10.17个(苏尼特羊)到95.99个(杜泊羊),平均长度的变化范围从2.04 Mb(四川藏羊)到4.71 Mb(罗布羊),平均F_(ROH)的变化范围从0.010(苏尼特羊)到0.172(杜泊羊)。引进品种的(杜泊羊和德美羊)平均F_(ROH)明显高于地方品种。在地方绵羊群体中,西藏藏羊(0.085)具有最高的平均F_(ROH)。在高频ROH区域鉴定到26个与绵羊经济性状相关的基因,如与生长发育相关的基因NCAPG、LCORL、PRKAA2、FAIM2和HYDIN,与脂肪代谢相关的基因LEPR、WNT10B和NCKAP5L,与肉质及胴体性状相关的基因CDIPT、CAPN3和FGF9。基于ROH评估的近交情况可为绵羊种群育种和保种提供参考依据,鉴定到的候选基因可以作为绵羊标记辅助选择重要的基因。
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| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ |
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