| 基于脾脏转录组筛选北京油鸡和广明白鸡抗热应激相关功能基因 |
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| 引用本文： | 王子渲,王巧,张锦,Astrid Lissette Barreto Sánchez,郑麦青,李庆贺,崔焕先,安炳星,赵桂苹,文杰,李和刚.基于脾脏转录组筛选北京油鸡和广明白鸡抗热应激相关功能基因[J].畜牧兽医学报,2023(5):1905-1914. |
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| 作者姓名： | 王子渲 王巧 张锦 Astrid Lissette Barreto Sánchez 郑麦青 李庆贺 崔焕先 安炳星 赵桂苹 文杰 李和刚 |
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| 作者单位： | 1. 青岛农业大学动物科技学院;2. 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 |
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| 摘 要： | 旨在通过对北京油鸡(BY)和“广明2号”白羽肉鸡B系(广明白鸡，GM)在热应激和正常饲养条件下的脾脏转录组进行分析，鉴定两鸡种在应对热应激时的差异表达基因和信号通路，解析不同鸡种耐热性能差异的分子调控机制。试验动物采用相同饲养条件下的25日龄北京油鸡和广明白鸡，测定异嗜性粒细胞与淋巴细胞的比值(H/L)、超氧化物歧化酶(SOD)和总抗氧化能力(T-AOC)等表型数据，采集脾脏组织进行转录组测序(RNA-Seq)。基于RNA-Seq数据，结合表型进行加权基因共表达网络分析(WGCNA),筛选出与性状相关性较高的模块与基因。脾脏转录组测序结果表明，热应激组相比于对照组，北京油鸡中共鉴定到313个差异表达基因，其中169个上调表达，144个下调表达；广明白鸡中鉴定到235个差异表达基因，其中152个上调表达，83个下调表达。利用WGCNA分析，在北京油鸡中筛选出2个与H/L相关性较高的模块，在广明白鸡中筛选出4个与H/L和T-AOC强相关的模块。通过筛选模块中的Hub基因，发现两品种中均存在TRIM29基因，说明该基因可能在抗热应激方面发挥重要作用。本研究通过转录组分析，揭示了不同鸡种在热应...
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| 关 键 词： | 北京油鸡 广明白鸡 热应激 差异表达基因 加权基因共表达网络分析 |
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