| 雷琼牛与陆丰牛背最长肌lncRNA表达特点及其相关ceRNA网络分析 |
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| 引用本文： | 杨闯,吴龙飞,柳广斌,李耀坤,刘德武,孙宝丽.雷琼牛与陆丰牛背最长肌lncRNA表达特点及其相关ceRNA网络分析[J].畜牧兽医学报,2023(5):1951-1963. |
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| 作者姓名： | 杨闯 吴龙飞 柳广斌 李耀坤 刘德武 孙宝丽 |
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| 作者单位： | 华南农业大学动物科学学院 |
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| 基金项目： | 广东省重点领域研发计划(2022B0202110002)； |
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| 摘 要： | 旨在筛选雷琼牛与陆丰牛背最长肌差异表达lncRNAs、miRNAs以及mRNAs,通过构建lncRNA-miRNA-mRNA的竞争调控网络、搜寻lncRNA顺式靶向调控基因并进行功能预测，挖掘可供提升华南地区地方品种黄牛肉用价值的关键候选基因。本研究随机选取4月龄雌性雷琼牛与陆丰牛各4头，取背最长肌组织用于RNA测序，测序结果使用RT-qPCR验证。筛选两品种黄牛背最长肌差异表达lncRNAs、miRNAs和mRNAs,用于构建差异表达转录本的竞争调控网络以及搜寻lncRNA顺式靶向调控基因。候选基因使用GO和KEGG富集分析进行功能预测。结果表明，以雷琼牛为对照组，两个品种中存在119个差异表达的lncRNAs,其中73个上调表达，46个下调表达；差异表达的miRNAs共有13个，其中7个上调表达，6个下调表达；差异表达的mRNAs共有599个，其中155个上调表达，444个下调表达。竞争性调控网络中mRNAs的GO富集结果显示，与肌生成相关的条目主要为磷酸化以及膜结构等，KEGG富集结果中与肌生成相关的通路主要为Rap1、MAPK、PI3K-Akt等信号通路。顺式靶向调控基因的GO...
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| 关 键 词： | 陆丰牛 雷琼牛 背最长肌 lncRNA ceRNA网络 |
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