| 大型迪庆藏猪不同生长阶段背脂与腹脂脂质代谢差异基因及调控网络分析 |
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| 引用本文： | 王琳,马黎,张博,邓俊,张浩,欧阳晓芳,严达伟,董新星.大型迪庆藏猪不同生长阶段背脂与腹脂脂质代谢差异基因及调控网络分析[J].畜牧兽医学报,2023,54(2):520-533. |
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| 作者姓名： | 王琳 马黎 张博 邓俊 张浩 欧阳晓芳 严达伟 董新星 |
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| 作者单位： | 1. 云南农业大学动物科学技术学院, 昆明 650201;2. 云南农业职业技术学院, 昆明 650212;3. 中国农业大学动物科学技术学院, 北京 100193;4. 云南省畜牧总站, 昆明 650224 |
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| 基金项目： | 云南省乡村振兴科技专项项目（202104BI090021）；云南省重大科技专项项目（202202AE090005）；云南省农业联合面上项目（2021BD070001-10） |
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| 摘 要： | 旨在筛选大型迪庆藏猪不同生长阶段、不同部位脂质代谢差异的关键基因。本研究选择胎次相同、出生日期相近、体重10 kg左右的大型迪庆藏猪36头，随机分为3组，相同条件育肥，分别在平均体重达40、80和120 kg时屠宰，测定胴体性能，每组采集3头猪的背脂和腹脂进行高通量转录组测序，测序数据经拼接、比对，筛选与脂质代谢相关的显著差异基因并进行GO、KEGG分析、基因互作网络分析。结果表明，40、80和120 kg大型迪庆藏猪腹脂vs.背脂分别筛到486、765和339个差异表达显著基因，随机挑选的EGR2、SOD3等5个差异表达显著基因的qPCR结果与转录组测序结果一致，差异表达显著基因主要富集在肌肉收缩、细胞黏附、间充质细胞增殖正调节等GO条目，心肌收缩、PI3K-Akt信号通路、Hippo信号通路等KEGG通路；40 kg组EGR2、RARRES2、TMOD4和SFRP2基因位于网络核心，EGR2、RARRES2、SFRP2在腹脂上调，TMOD4下调；80 kg组THBS1、PPARA、NRIP1和LPL基因位于网络核心，4个核心基因均在腹脂上调；120 kg组HTRA1、TSHR、LR...
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| 关 键 词： | 迪庆藏猪 脂肪差异沉积 功能基因 基因互作网络 |
| 收稿时间： | 2022-07-12 |
Key Genes and Regulatory Network Analysis of Lipid Metabolism Differences between Back Fat and Abdominal Fat of Large Diqing Tibetan Pigs at Different Growth Stages |
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| WANG Lin,MA Li,ZHANG Bo,DENG Jun,ZHANG Hao,OUYANG Xiaofang,YAN Dawei,DONG Xinxing.Key Genes and Regulatory Network Analysis of Lipid Metabolism Differences between Back Fat and Abdominal Fat of Large Diqing Tibetan Pigs at Different Growth Stages[J].Acta Veterinaria et Zootechnica Sinica,2023,54(2):520-533. |
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| Authors: | WANG Lin MA Li ZHANG Bo DENG Jun ZHANG Hao OUYANG Xiaofang YAN Dawei DONG Xinxing |
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| Institution: | 1. College of Animal Science and Technology, Yunnan Agricultural University, Kunming 650201, China;2. Yunnan Vocational and Technical College of Agriculture, Kunming 650212, China;3. College of Animal Science and Technology, China Agricultural University, Beijing 100193, China;4. Yunnan Province Animal Husbandry Station, Kunming 650224, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Diqing Tibetan pigs differential fat deposition functional genes gene interaction networks |
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