| 猪精氨酸-丝氨酸蛋白激酶1(SRPK1)克隆表达及功能初步分析 |
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| 引用本文： | 俄广鑫,刘娣,张冬杰,杨秀琴,崔羽,祝继原,杨少成,王嘉博,谢宇彤.猪精氨酸-丝氨酸蛋白激酶1(SRPK1)克隆表达及功能初步分析[J].畜牧兽医学报,2010,41(11). |
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| 作者姓名： | 俄广鑫 刘娣 张冬杰 杨秀琴 崔羽 祝继原 杨少成 王嘉博 谢宇彤 |
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| 作者单位： | 东北农业大学动物科学技术学院;黑龙江省农业科学院畜牧中心;海南大学农学院; |
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| 基金项目： | "十一五"国家科技支撑计划重点项目 |
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| 摘 要： | 本研究旨在阐明猪SRPK1基因的分子特点和表达谱。以大白猪为研究对象,利用RT-PCR技术克隆SRPK1基因CDS区域,同时利用反向PCR(inverse PCR,I-PCR)技术得到猪部分SRPK1的5′UTR序列;利用生物信息学方法分析SRPK1基因核苷酸序列及编码蛋白序列的结构特点;利用荧光定量PCR(real-time PCR)检测SRPK1在1和30日龄大白猪及杜洛克的心脏、肌肉、脾脏、肝脏、肾脏、肺脏、胃、小肠、大肠、脑的表达情况;构建猪骨骼肌损伤模型,研究在骨骼肌发育过程中SRPK1基因的表达特性。结果,将克隆片段拼接得到长2499bp的大白猪SRPK1基因序列,包含了1968bp完整CDS区域,分析表明其编码含656个氨基酸的蛋白质;包括2个P_Kc结构域,猪SRPK1蛋白序列与人和黑猩猩的相似性较高。通过生物信息学方法预测所得5′UTR含有多个转录结合位点:HSF1、HSF2、Ik-1、IK-2、SRY、SP1MyoD、USF、E47、p300、CP2、RREB-1、E2F和AP-1。利用荧光定量PCR研究发现,表达结果显示猪该基因表达具有组织和种间特异性,主要都是在胃、大肠和小肠中表达。SR-PK1基因在整个损伤修复过程中的表达反复出现升高和降低。5′UTR处有多个和肌肉生长相关蛋白的转录结合位点,主要在消化系统组织表达,在骨骼肌修复中表达上调,推测其可能与骨骼肌细胞发育或其他肌肉生长相关因子的表达有关。
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| 关 键 词： | 精氨酸/丝氨酸蛋白激酶1 猪 实时荧光定量PCR 反向PCR 骨骼肌损伤模型 生物信息学分析 |
Cloning and Functional Analysis of Serine/arginine-rich Specific Kinase 1 in Pig |
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| E Guang-xin,LIU Di,ZHANG Dong-jie,YANG Xiu-qin,CUI Yu,ZHU Ji-yuan,YANG Shao-cheng,WANG Jia-bo,XIE Yu-tong.Cloning and Functional Analysis of Serine/arginine-rich Specific Kinase 1 in Pig[J].Acta Veterinaria et Zootechnica Sinica,2010,41(11). |
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| Authors: | E Guang-xin LIU Di ZHANG Dong-jie YANG Xiu-qin CUI Yu ZHU Ji-yuan YANG Shao-cheng WANG Jia-bo XIE Yu-tong |
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| Institution: | E Guang-xin1,LIU Di 2,ZHANG Dong-jie2,YANG Xiu-qin1,CUI Yu 3,ZHU Ji-yuan1,YANG Shao-cheng1,WANG Jia-bo1,XIE Yu-tong1(1.College of Animal Science and Technology,Northeast Agricultural University,Harbin 150030,China,2.Animal Husbandry Center,Heilongjiang Academy of Agricultural Sciences,Harbin 150086,3.Hainan University of Agriculture,Haikou 570228,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | SRPK1 pig real-time PCR inverse PCR (I-PCR) skeletal muscle injury model bioinformatics analysis |
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